2003 Kyrgyzská národní agrární univerzita, Biškek, Kyrgyzstán
Žeenbekov navštěvoval Kyrgyzskou zemědělskou akademii, kterou absolvoval v oboru zootechnika. V roce 2003 dokončil další studium a získal diplom v oboru účetnictví na Kyrgyzské národní agrární univerzitě.
