Der Amerikanische Bürgerkrieg brach aus
Als der Amerikanische Bürgerkrieg ausbrach, halfen die Blackwell-Schwestern bei der Krankenpflege. Blackwell sympathisierte aufgrund ihrer abolitionistischen Wurzeln stark mit dem Norden und ging sogar so weit zu sagen, dass sie das Land verlassen hätte, wenn der Norden in der Frage der Sklaverei Kompromisse eingegangen wäre. Blackwell stieß jedoch auf Widerstand seitens der männlich dominierten United States Sanitary Commission (USSC). Die männlichen Ärzte weigerten sich, bei dem Ausbildungsprogramm für Krankenschwestern zu helfen, wenn die Blackwells daran beteiligt waren. Als Reaktion auf die USSC organisierte sich Blackwell mit der Woman's Central Relief Association (WCRA). Die WCRA arbeitete gegen das Problem der unkoordinierten Wohltätigkeit, wurde aber letztlich von der USSC absorbiert. Dennoch gelang es der New York Infirmary, mit Dorothea Dix zusammenzuarbeiten, um Krankenschwestern für die Bemühungen der Union auszubilden.