Η Ειρήνη της Βεστφαλίας
Το πραγματικό τέλος της αυτοκρατορίας ήρθε σε διάφορα στάδια. Η Ειρήνη της Βεστφαλίας το 1648, η οποία τερμάτισε τον Τριακονταετή Πόλεμο, έδωσε στα εδάφη σχεδόν πλήρη ανεξαρτησία. Ο Καλβινισμός επιτράπηκε πλέον, αλλά οι Αναβαπτιστές, οι Αρμινιανοί και άλλες προτεσταντικές κοινότητες εξακολουθούσαν να στερούνται οποιασδήποτε υποστήριξης και να συνεχίζουν να διώκονται μέχρι το τέλος της Αυτοκρατορίας. Η Ελβετική Συνομοσπονδία, η οποία είχε ήδη καθιερώσει οιονεί ανεξαρτησία το 1499, καθώς και οι Βόρειες Κάτω Χώρες, εγκατέλειψαν την Αυτοκρατορία. Οι Αψβούργοι Αυτοκράτορες επικεντρώθηκαν στην εδραίωση των δικών τους κτημάτων στην Αυστρία και αλλού. Οι συνθήκες της Βεστφαλίας έθεσαν τέλος σε μια καταστροφική περίοδο της ευρωπαϊκής ιστορίας που προκάλεσε τον θάνατο περίπου οκτώ εκατομμυρίων ανθρώπων. Οι μελετητές έχουν αναγνωρίσει τη Βεστφαλία ως την αρχή του σύγχρονου διεθνούς συστήματος, βασισμένου στην έννοια της βεστφαλιανής κυριαρχίας, αν και αυτή η ερμηνεία έχει αμφισβητηθεί.
