Επιστροφή στην Αγγλία
Το 1804, ο Φούλτον άλλαξε πίστη και μετακόμισε στη Βρετανία, όπου έλαβε εντολή από τον Πρωθυπουργό Ουίλιαμ Πιτ τον Νεότερο να κατασκευάσει μια σειρά όπλων για χρήση από το Βασιλικό Ναυτικό κατά τη διάρκεια των φόβων για εισβολή του Ναπολέοντα. Μεταξύ των εφευρέσεών του ήταν οι πρώτες σύγχρονες ναυτικές «τορπίλες» στον κόσμο (σύγχρονες «νάρκες»). Αυτές δοκιμάστηκαν, μαζί με πολλές άλλες εφευρέσεις του, κατά τη διάρκεια της επιδρομής στη Βουλώνη το 1804, αλλά είχαν περιορισμένη επιτυχία. Αν και ο Φούλτον συνέχισε να αναπτύσσει τις εφευρέσεις του με τους Βρετανούς μέχρι το 1806, η αποφασιστική ναυτική νίκη του Ναυάρχου Οράτιου Νέλσον στη Ναυμαχία του Τραφάλγκαρ το 1805 μείωσε σημαντικά τον κίνδυνο γαλλικής εισβολής. Ο Φούλτον άρχισε να αγνοείται όλο και περισσότερο.
