Guerra Civil Española

Dos años después, le ofrecieron la dirección de la Sección de Fisiología en un recién creado Instituto de Investigación Médica en la Facultad de Medicina de la Universidad de Madrid. Desafortunadamente, el nombramiento se produjo justo cuando estalló la Guerra Civil Española. Ochoa decidió que intentar investigar en tal entorno destruiría para siempre sus "posibilidades de convertirme en científico". Por lo tanto, "después de mucho pensarlo, mi esposa y yo decidimos abandonar España".

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