מלחמת האזרחים האמריקנית פרצה
כאשר פרצה מלחמת האזרחים האמריקנית, האחיות לבית בלקוול סייעו במאמצי הסיעוד. בלקוול הזדהתה מאוד עם הצפון בשל שורשיה כמתנגדת עבדות, ואף הרחיקה לכת ואמרה שהייתה עוזבת את המדינה אילו הצפון היה מתפשר בנושא העבדות. עם זאת, בלקוול נתקלה בהתנגדות מצד הוועדה הסניטרית של ארצות הברית (USSC) שנשלטה על ידי גברים. הרופאים הגברים סירבו לסייע בתוכנית הכשרת האחיות אם היא כללה את האחיות בלקוול. בתגובה ל-USSC, בלקוול התארגנה עם איגוד הסיוע המרכזי לנשים (WCRA). ה-WCRA פעלה נגד בעיית הנדבנות הלא מתואמת, אך בסופו של דבר נבלעה על ידי ה-USSC. ובכל זאת, המרפאה של ניו יורק הצליחה לעבוד עם דורותיאה דיקס כדי להכשיר אחיות עבור מאמץ האיחוד.
