תחת הקיסרות השנייה (1852–1871), יושם "קוד הילידים" (Code de l'indigénat) על ידי ה-Sénatus-consulte ב-14 ביולי 1865. הוא אפשר למוסלמים להגיש בקשה לאזרחות צרפתית מלאה, צעד שמעטים נקטו בו, שכן הוא דרש ויתור על הזכות להתנהל לפי חוקי השריעה בעניינים אישיים ונחשב לסוג של כפירה.
