עונת 2008–09 השתפרה עבור אוניל, שהעמיד ממוצעים של 18 נקודות, 9 ריבאונדים ו-1.6 חסימות במהלך המחצית הראשונה (41 משחקים) של העונה, והוביל את הסאנס למאזן של 23–18 ולמקום השני בחטיבה שלהם. הוא חזר למשחק האולסטאר ב-2009 והוכתר כ-co-MVP יחד עם חברו לקבוצה לשעבר קובי בראיינט.
