वेनेजुएला को स्वतंत्र घोषित किया गया
तथ्यों के बाद, बोलिवर गुटीय विवादों से घिरे हुए एक दुर्लभ वातावरण में शासन करना जारी रखा। अगले दो वर्षों के दौरान न्यू ग्रेनाडा, वेनेजुएला और इक्वाडोर में विद्रोह हुए। अलगाववादियों ने उन पर गणतंत्र के सिद्धांतों के साथ विश्वासघात करने और स्थायी तानाशाही स्थापित करने की इच्छा रखने का आरोप लगाया। जब राष्ट्रपति जनरल ला मार ने गुआयाकिल पर आक्रमण किया तो ग्रैन कोलंबिया ने पेरू के खिलाफ युद्ध की घोषणा कर दी। बाद में उन्हें 27 फरवरी 1829 को पोर्टेटे डी टारकी की लड़ाई में मार्शल एंटोनियो जोस डी सुक्रे द्वारा हराया गया। सुक्रे की हत्या 4 जून 1830 को कर दी गई। जनरल जुआन जोस फ्लोरेस दक्षिणी विभागों (क्विटो, गुआयाकिल और अज़ुय) को, जिन्हें इक्वाडोर जिले के रूप में जाना जाता है, ग्रैन कोलंबिया से अलग करके एक स्वतंत्र देश बनाना चाहते थे और इसके पहले राष्ट्रपति बनना चाहते थे। वेनेजुएला को 13 जनवरी 1830 को स्वतंत्र घोषित किया गया और जोस एंटोनियो पेज़ ने उस देश की अध्यक्षता बनाए रखी, और बोलिवर को निर्वासित कर दिया।