Liga Komunis bubar
Pada Januari 1990, Liga Komunis bubar berdasarkan garis etnis, dengan faksi Kroasia dan Slovenia menuntut federasi yang lebih longgar pada Kongres Luar Biasa ke-14.

Minggu Mar 31, 1991 sampai Minggu Nov 12, 1995
Croatia
Perang Kemerdekaan Kroasia berlangsung dari tahun 1991 hingga 1995 antara pasukan Kroasia yang setia kepada pemerintah Kroasia—yang telah menyatakan kemerdekaan dari Republik Federal Sosialis Yugoslavia (SFRY)—dan Tentara Rakyat Yugoslavia (JNA) yang dikendalikan Serbia serta pasukan lokal Serbia, dengan JNA mengakhiri operasi tempurnya di Kroasia pada tahun 1992. Di Kroasia, perang ini terutama disebut sebagai "Perang Tanah Air" (Domovinski rat) dan juga sebagai "Agresi Serbia Raya". Dalam sumber-sumber Serbia, istilah "Perang di Kroasia" (Rat u Hrvatskoj) dan "Perang di Krajina" (Rat u Krajini) digunakan.
Pada Januari 1990, Liga Komunis bubar berdasarkan garis etnis, dengan faksi Kroasia dan Slovenia menuntut federasi yang lebih longgar pada Kongres Luar Biasa ke-14.
Pada Februari 1990, Jovan Rašković mendirikan Partai Demokrat Serbia (SDS) di Knin, yang programnya bertujuan untuk mengubah pembagian wilayah Kroasia agar selaras dengan kepentingan etnis Serbia.
Pada 4 Maret 1990, 50.000 orang Serbia berunjuk rasa di Petrova Gora dan meneriakkan komentar negatif yang ditujukan kepada Tuđman, meneriakkan "Ini adalah Serbia", dan menyatakan dukungan untuk Milošević.
Pemilihan umum bebas pertama di Kroasia dan Slovenia dijadwalkan beberapa bulan kemudian. Putaran pertama pemilihan di Kroasia diadakan pada 22 April, dan putaran kedua pada 6 Mei.
Suasana tegang meliputi pada 13 Mei 1990, ketika pertandingan sepak bola diadakan di Zagreb di Stadion Maksimir antara tim Dinamo Zagreb dan Red Star Beograd. Pertandingan tersebut meletus menjadi kekerasan antara penggemar Kroasia dan Serbia serta dengan polisi.
Pada 14 Mei 1990, senjata TO (Pertahanan Teritorial) Kroasia, di wilayah mayoritas Kroasia, diambil oleh JNA, mencegah kemungkinan Kroasia memiliki senjatanya sendiri seperti yang dilakukan di Slovenia. Borisav Jović, perwakilan Serbia di Kepresidenan Federal dan sekutu dekat Slobodan Milošević, mengklaim bahwa tindakan ini dilakukan atas perintah Serbia.
Pada 30 Mei 1990, Parlemen Kroasia yang baru mengadakan sesi pertamanya.
Menurut Jović, pada 27 Juni 1990 ia dan Veljko Kadijević, Menteri Pertahanan Yugoslavia, bertemu dan sepakat bahwa mereka harus, mengenai Kroasia dan Slovenia, "mengusir mereka secara paksa dari Yugoslavia, dengan hanya menarik perbatasan dan menyatakan bahwa mereka telah membawa ini pada diri mereka sendiri melalui keputusan mereka". Menurut Jović, keesokan harinya ia memperoleh persetujuan dari Milošević.
Setelah pemilihan Tuđman (Presiden Kroasia) dan HDZ, Majelis Serbia didirikan di Srb, utara Knin, pada 25 Juli 1990 sebagai perwakilan politik rakyat Serbia di Kroasia. Majelis Serbia menyatakan "kedaulatan dan otonomi rakyat Serbia di Kroasia".
Pada Agustus 1990, sebuah referendum mono-etnis yang tidak diakui diadakan di wilayah-wilayah dengan populasi Serbia yang substansial yang nantinya akan dikenal sebagai Republik Krajina Serbia (RSK) (berbatasan dengan Bosnia dan Herzegovina bagian barat) mengenai pertanyaan tentang "kedaulatan dan otonomi" Serbia di Kroasia.
Pada 21 Desember 1990, SAO Krajina (Oblast Otonom Serbia Krajina) diproklamasikan oleh kotamadya di wilayah Dalmatia Utara dan Lika, di Kroasia barat daya. Pasal 1 Statuta SAO Krajina mendefinisikan SAO Krajina sebagai "bentuk otonomi teritorial dalam Republik Kroasia" di mana Konstitusi Republik Kroasia, hukum negara, dan Statuta SAO Krajina diterapkan.
Pada 22 Desember 1990, Parlemen Kroasia meratifikasi konstitusi baru, yang dipandang oleh orang Serbia sebagai penghapusan hak-hak yang telah diberikan oleh konstitusi sosialis.
Konflik meningkat menjadi insiden bersenjata di daerah-daerah yang berpenduduk mayoritas Serbia. Orang Serbia menyerang unit polisi Kroasia di Pakrac pada awal Maret.
Josip Jović secara luas dilaporkan sebagai petugas polisi pertama yang tewas oleh pasukan Serbia sebagai bagian dari perang, selama insiden Danau Plitvice pada akhir Maret 1991.
Pada 12 Maret 1991, pimpinan Angkatan Darat bertemu dengan Kepresidenan SFRY dalam upaya untuk meyakinkan mereka agar menyatakan keadaan darurat yang akan memungkinkan tentara untuk mengambil kendali negara.
Militer Kroasia berada dalam kondisi yang jauh lebih buruk daripada militer Serbia. Pada tahap awal perang, kurangnya unit militer berarti pasukan Polisi Kroasia harus menanggung beban pertempuran. Garda Nasional Kroasia, militer Kroasia yang baru, dibentuk pada 11 April 1991, dan secara bertahap berkembang menjadi Tentara Kroasia pada tahun 1993.
Di Tovarnik, seorang polisi Kroasia tewas oleh paramiliter Serbia pada 2 Mei.
Sementara di Sotin, seorang warga sipil Serbia tewas pada 5 Mei ketika ia terjebak dalam baku tembak antara paramiliter Serbia dan Kroasia.
Pada 6 Mei, protes 1991 di Split menentang pengepungan Kijevo di Komando Angkatan Laut di Split mengakibatkan kematian seorang tentara Tentara Rakyat Yugoslavia.
Pada 15 Mei, Stjepan Mesić, seorang Kroasia, dijadwalkan menjadi ketua kepresidenan bergilir Yugoslavia. Serbia, dibantu oleh Kosovo, Montenegro, dan Vojvodina, yang suara kepresidenannya pada saat itu berada di bawah kendali Serbia, memblokir penunjukan tersebut, yang sebenarnya dianggap sebagian besar bersifat seremonial.
Pada 19 Mei 1991, pihak berwenang Kroasia mengadakan referendum kemerdekaan dengan opsi untuk tetap berada di Yugoslavia sebagai persatuan yang lebih longgar. Pihak berwenang lokal Serbia mengeluarkan seruan untuk memboikot, yang sebagian besar diikuti oleh orang Serbia Kroasia. Referendum tersebut lolos dengan 94% suara mendukung.
Unit-unit militer Kroasia yang baru dibentuk mengadakan parade dan tinjauan militer di Stadion Kranjčevićeva di Zagreb pada 28 Mei 1991.
Parlemen Kroasia menyatakan kemerdekaan Kroasia dan membubarkan asosiasinya dengan Yugoslavia pada 25 Juni 1991.
Pada bulan Juni dan Juli 1991, konflik bersenjata singkat terjadi di Slovenia.
Pada Agustus 1991, Tentara Kroasia memiliki kurang dari 20 brigade.
Pada Agustus 1991, Pertempuran Vukovar dimulai. Pertempuran Vukovar adalah pengepungan selama 87 hari terhadap Vukovar di Kroasia timur oleh Tentara Rakyat Yugoslavia (JNA), yang didukung oleh berbagai pasukan paramiliter dari Serbia, antara Agustus dan November 1991. Sebelum Perang Kemerdekaan Kroasia, kota bergaya Barok ini merupakan komunitas makmur yang terdiri dari campuran orang Kroasia, Serbia, dan kelompok etnis lainnya. Saat Yugoslavia mulai terpecah, Presiden Serbia Slobodan Milošević dan Presiden Kroasia Franjo Tuđman mulai menjalankan politik nasionalis. Pada tahun 1990, pemberontakan bersenjata dimulai oleh milisi Serbia Kroasia, yang didukung oleh pemerintah Serbia dan kelompok paramiliter, yang menguasai wilayah-wilayah berpenduduk Serbia di Kroasia. JNA mulai melakukan intervensi untuk mendukung pemberontakan tersebut, dan konflik pecah di wilayah Slavonia, Kroasia timur pada Mei 1991. Pada bulan Agustus, JNA meluncurkan serangan skala penuh terhadap wilayah yang dikuasai Kroasia di Slavonia timur, termasuk Vukovar.
Komisi Arbitrase Konferensi Perdamaian tentang Yugoslavia, yang juga disebut sebagai Komite Arbitrase Badinter, dibentuk oleh Dewan Menteri Masyarakat Ekonomi Eropa (EEC) pada 27 Agustus 1991, untuk memberikan nasihat hukum kepada Konferensi tentang Yugoslavia.
Langkah ini menyusul kebuntuan selama berbulan-bulan atas posisi JNA di Dalmatia dan tempat lain yang sekarang dikenal sebagai Pertempuran barak.
Hal ini juga bertepatan dengan berakhirnya Operasi Coast-91, di mana JNA gagal menduduki garis pantai dalam upaya untuk memutus akses Dalmatia ke wilayah Kroasia lainnya.
Pada 3 Oktober, Angkatan Laut Yugoslavia memperbarui blokadenya terhadap pelabuhan-pelabuhan utama Kroasia.
Pada 5 Oktober, Presiden Tuđman menyampaikan pidato di mana ia menyerukan kepada seluruh penduduk untuk melakukan mobilisasi dan bertahan melawan "imperialisme Serbia Raya" yang dijalankan oleh JNA yang dipimpin Serbia, formasi paramiliter Serbia, dan pasukan pemberontak Serbia.
Pada 7 Oktober, angkatan udara Yugoslavia menyerang gedung pemerintahan utama di Zagreb, sebuah insiden yang disebut sebagai pengeboman Banski dvori.
Keesokan harinya, saat moratorium tiga bulan yang disepakati sebelumnya mengenai pelaksanaan deklarasi kemerdekaan berakhir, Parlemen Kroasia memutuskan semua hubungan yang tersisa dengan Yugoslavia. 8 Oktober sekarang dirayakan sebagai Hari Kemerdekaan di Kroasia.
Pada 15 Oktober setelah penangkapan Cavtat oleh JNA, penduduk lokal Serbia yang dipimpin oleh Aco Apolonio memproklamasikan Republik Dubrovnik.
Pasukan Kroasia membuat kemajuan lebih lanjut pada paruh kedua bulan Desember, termasuk Operasi Orkan 91 yang merupakan ofensif militer yang dilakukan oleh Tentara Kroasia (Hrvatska vojska – HV) terhadap Tentara Rakyat Yugoslavia (Jugoslovenska Narodna Armija – JNA) dan Pasukan Pertahanan Teritorial SAO Slavonia Barat di lembah Sungai Sava, di wilayah Slavonia Barat selama Perang Kemerdekaan Kroasia. Operasi tersebut dimulai pada 29 Oktober 1991 dan berakhir pada 3 Januari 1992 ketika gencatan senjata nasional ditandatangani untuk melaksanakan rencana Vance. Ofensif tersebut bertujuan untuk merebut kembali wilayah tersebut, bersama dengan dua ofensif HV lainnya yang diluncurkan terhadap SAO Slavonia Barat di utara wilayah tersebut dalam beberapa hari.
Operasi Otkos 10 (31 Oktober hingga 4 November) menghasilkan keberhasilan Kroasia merebut kembali area di antara pegunungan Bilogora dan Papuk.
Tentara Kroasia memulai serangan balik yang sukses pada awal November 1991, operasi ofensif besar pertamanya dalam perang tersebut.
Pada 14 November, blokade Angkatan Laut terhadap pelabuhan-pelabuhan Dalmatia ditantang oleh kapal-kapal sipil. Konfrontasi tersebut memuncak dalam Pertempuran saluran Dalmatia, ketika artileri pesisir dan pulau Kroasia merusak, menenggelamkan, atau menangkap sejumlah kapal angkatan laut Yugoslavia, termasuk Mukos PČ 176, yang kemudian dinamai ulang menjadi PB 62 Šolta.
Pada 19 Desember, seiring meningkatnya intensitas pertempuran, Kroasia memenangkan pengakuan diplomatik pertamanya oleh negara barat—Islandia—sementara Oblast Otonom Serbia di Krajina dan Slavonia barat secara resmi menyatakan diri sebagai Republik Krajina Serbia.
Pada 21 Desember 1991 untuk pertama kalinya dalam perang tersebut, Istria diserang.
Pada 26 Desember 1991, kepresidenan federal yang didominasi Serbia mengumumkan rencana untuk Yugoslavia yang lebih kecil yang dapat mencakup wilayah yang direbut dari Kroasia selama perang.
Kroasia kehilangan banyak wilayah, tetapi memperluas Tentara Kroasia dari tujuh brigade yang dimilikinya pada saat gencatan senjata pertama menjadi 60 brigade dan 37 batalion independen pada 31 Desember 1991.
Gencatan senjata baru yang disponsori PBB, yang kelima belas dalam waktu hanya enam bulan, disepakati pada 2 Januari 1992, dan mulai berlaku keesokan harinya.
Apa yang disebut Perjanjian Sarajevo ini menjadi gencatan senjata yang bertahan lama. Kroasia secara resmi diakui oleh Komunitas Eropa pada 15 Januari 1992.
UNPROFOR (Pasukan Perlindungan Perserikatan Bangsa-Bangsa) secara resmi dibentuk oleh Resolusi Dewan Keamanan PBB 743 pada 21 Februari 1992.
Kroasia menjadi anggota PBB pada 22 Mei 1992, yang bersyarat pada Kroasia yang harus mengamandemen konstitusinya untuk melindungi hak asasi manusia kelompok minoritas dan pembangkang.
Operasi Jaguar di Bukit Križ dekat Bibinje dan Zadar, pada 22 Mei 1992.
Serangkaian aksi militer di pedalaman Dubrovnik: Operasi Tigar, pada 1–13 Juli 1992.
Pada tahun 1992, konflik Kroasia-Bosnia meletus di Bosnia dan Herzegovina, tepat saat masing-masing pihak sedang berperang dengan Serbia Bosnia. Perang ini awalnya terjadi antara Dewan Pertahanan Kroasia dan pasukan sukarelawan Kroasia di satu sisi dan Tentara Republik Bosnia dan Herzegovina (ARBiH) di sisi lain, namun pada tahun 1994, Tentara Kroasia diperkirakan memiliki 3.000 hingga 5.000 tentara yang terlibat dalam pertempuran tersebut.
Tentara Kroasia meluncurkan Operasi Maslenica, sebuah operasi ofensif di wilayah Zadar pada 22 Januari.
Pada 18 Februari 1993, otoritas Kroasia menandatangani Perjanjian Daruvar dengan para pemimpin Serbia setempat di Slavonia Barat. Tujuan dari perjanjian rahasia ini adalah menormalkan kehidupan bagi penduduk setempat di dekat garis depan. Namun, otoritas di Knin mengetahui hal ini dan menangkap para pemimpin Serbia yang bertanggung jawab.
Pengadilan Pidana Internasional untuk bekas Yugoslavia (ICTY) dibentuk berdasarkan Resolusi Dewan Keamanan PBB 827, yang disahkan pada 25 Mei 1993.
Pada Juni 1993, orang-orang Serbia mulai memberikan suara dalam referendum mengenai penggabungan wilayah Krajina dengan Republika Srpska.
Operasi Kantong Medak terjadi di sebuah tonjolan di selatan Gospić, dari 9–17 September. Serangan ini dilakukan oleh tentara Kroasia untuk menghentikan artileri Serbia di wilayah tersebut agar tidak menembaki Gospić di dekatnya.
Di bawah tekanan dari Amerika Serikat, pihak-pihak yang bertikai menyetujui gencatan senjata pada akhir Februari, diikuti dengan pertemuan perwakilan Kroasia, Bosnia, dan Kroasia Bosnia dengan Menteri Luar Negeri AS Warren Christopher di Washington, D.C. pada 26 Februari 1994.
Pada 4 Maret, Franjo Tuđman mendukung perjanjian yang mengatur pembentukan Federasi Bosnia dan Herzegovina serta aliansi antara tentara Bosnia dan Kroasia melawan pasukan Serbia.
Pada 21 November, NATO menyerang lapangan terbang Udbina yang dikuasai oleh RSK, untuk sementara melumpuhkan landasan pacu. Setelah serangan Udbina, NATO terus melancarkan serangan di wilayah tersebut.
Pada 23 November, setelah pesawat pengintai NATO disinari oleh radar sistem rudal permukaan-ke-udara (SAM), pesawat NATO menyerang situs SAM di dekat Dvor dengan rudal anti-radiasi AGM-88 HARM.
Dari 29 November – 24 Desember dalam operasi Musim Dingin '94 di dekat Dinara dan Livno. Operasi ini dilakukan untuk mengalihkan perhatian dari pengepungan wilayah Bihać dan untuk mendekati ibu kota RSK, Knin, dari utara, mengisolasinya di tiga sisi.
Dari 25–30 Juli, Tentara Kroasia dan pasukan Dewan Pertahanan Kroasia (HVO) menyerang wilayah yang dikuasai Serbia di utara Gunung Dinara, merebut Bosansko Grahovo dan Glamoč selama Operasi Musim Panas '95.
Pada 4 Agustus, Kroasia memulai Operasi Badai, dengan tujuan merebut kembali hampir seluruh wilayah pendudukan di Kroasia, kecuali sebidang tanah yang relatif kecil, yang terletak di sepanjang sungai Danube, pada jarak yang cukup jauh dari sebagian besar tanah yang diperebutkan. Serangan yang melibatkan 100.000 tentara Kroasia ini merupakan pertempuran darat tunggal terbesar yang terjadi di Eropa sejak Perang Dunia II. Operasi Badai mencapai tujuannya dan dinyatakan selesai pada 8 Agustus.
Pertempuran lebih lanjut dapat dihindari pada 12 November ketika Perjanjian Erdut ditandatangani oleh penjabat menteri pertahanan RSK Milan Milanović, atas instruksi yang diterima dari Slobodan Milošević dan pejabat Republik Federal Yugoslavia.
Karena UNTAES menggantikan misi UNCRO, semenanjung Prevlaka, yang sebelumnya berada di bawah kendali UNCRO, ditempatkan di bawah kendali Misi Pengamat Perserikatan Bangsa-Bangsa di Prevlaka (UNMOP). UNMOP dibentuk berdasarkan Resolusi Dewan Keamanan PBB 1038 tanggal 15 Januari 1996, dan berakhir pada 15 Desember 2002.
Misi PBB yang baru dibentuk sebagai Otoritas Transisi Perserikatan Bangsa-Bangsa untuk Slavonia Timur, Baranja, dan Sirmium Barat (UNTAES) berdasarkan Resolusi Dewan Keamanan PBB 1037 tanggal 15 Januari 1996.
Periode transisi kemudian diperpanjang selama satu tahun. Pada 15 Januari 1998, mandat UNTAES berakhir dan Kroasia mendapatkan kembali kendali penuh atas wilayah tersebut.