La prima volta confermata in cui Al-Zawahiri ha intrapreso azioni militanti contro il governo pakistano

Nel luglio 2007, Al-Zawahiri fornì indicazioni per l'assedio della Lal Masjid, nome in codice Operazione Silenzio. Questa fu la prima volta confermata in cui Al-Zawahiri intraprese azioni militanti contro il governo pakistano e guidò i militanti islamici contro lo Stato del Pakistan. Le truppe dell'esercito pakistano e il Gruppo di Servizi Speciali che presero il controllo della Lal Masjid ("Moschea Rossa") a Islamabad trovarono lettere di al-Zawahiri che dirigevano i militanti islamici Abdul Rashid Ghazi e Abdul Aziz Ghazi, che gestivano la moschea e la madrasa adiacente. Questo conflitto provocò 100 morti.

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