1誕生
アイマン・ザワヒリは1951年、当時のエジプト王国カイロのマアディ地区で、ムハンマド・ラビー・アッ＝ザワヒリとウマイマ・アッザームの間に生まれた。
2ムスリム同胞団への加入
14歳までに、ザワヒリはムスリム同胞団に加入した。ザワヒリは他の4人の高校生と共に、「政府を転覆させ、イスラム国家を樹立することに専念する地下組織」の結成を支援した。この幼い時期に、ザワヒリは「クトゥブのビジョンを実行に移す」という人生の使命を抱くようになった。彼の組織は最終的に他の組織と合併し、アル・ジハード（エジプト・イスラム・ジハード）を結成した。
3卒業
アイマン・ザワヒリは、勤勉な若者であったと伝えられている。学校では優秀で、詩を愛し、「非人道的」だと考えていた「暴力的なスポーツを嫌った」。ザワヒリはカイロ大学で医学を学び、1974年に優秀な成績で卒業し、1978年に外科の修士号を取得した。
4最初の結婚
1978年、ザワヒリはカイロ大学で哲学を学んでいた学生、アッザ・アフマド・ヌワリと最初の結婚をした。オペラ広場のコンチネンタル・ホテルで行われた結婚式は非常に保守的で、男女の席は分けられ、音楽や写真撮影、陽気な冗談などは一切なかった。
5アンワル・サダト大統領暗殺事件
1981年、アンワル・サダト大統領暗殺事件の後、ザワヒリは数百人の逮捕者の一人となった。
6ビンラディンとの初対面
アイマン・ザワヒリが最初にビンラディンと会ったのは1986年のジェッダでのことであり、当時すでに有能な外科医として知られていた。彼の組織がビンラディンのアルカイダと合併した際、彼はビンラディンの個人的な顧問および主治医となった。
7エジプト・イスラム・ジハードの指導者
ザワヒリは、他の亡命過激派と共にエジプト・イスラム・ジハード（EIJ）の再建を開始した。このグループは「投獄されている名目上の指導者アブド・アル＝ズムルとは非常に希薄な関係」にあった。1991年、EIJはアル＝ズムルと決別し、ザワヒリが「権力の座」を掌握してEIJの指導者となった。
8ザワヒリの指導下におけるエジプト・イスラム・ジハードの最初の成功
1995年のパキスタン・イスラマバードにあるエジプト大使館への攻撃は、ザワヒリの指導下におけるエジプト・イスラム・ジハードの最初の成功であったが、ビンラディンはこの作戦を承認していなかった。この爆破事件は、「アフガニスタンへの最良のルート」であったパキスタンとの関係を悪化させた。
9チェチェンへの旅
1996年12月1日、アフマド・サラーマ・マブルークとマフムード・ヒシャーム・アル＝ヘンナーウィは、偽造パスポートを所持してザワヒリのチェチェンへの旅に同行した。彼らはそこで衰退しつつあったジハードを再建することを望んでいた。指導者であるザワヒリは、アブドゥッラー・イマーム・ムハンマド・アミーンという偽名で旅行し、医師としての資格を正当性の根拠として利用していた。グループは3回車両を乗り換えたが、ロシア領内に入ってから数時間以内に逮捕され、裁判を待つ間、マハチカラの刑務所で5ヶ月間を過ごした。
10ロシアでの投獄
1997年4月、3人（アフマド・サラーマ・マブルーク、マフムード・ヒシャーム・アル＝ヘンナーウィ、ザワヒリ）は禁錮6ヶ月の判決を受けたが、その1ヶ月後に釈放された。彼らは「貧困」を理由に、国選弁護人のアブルカリク・アブドゥサラモフに1,800ドルの弁護士費用を支払わずに逃亡した。
11ルクソール事件
その間、ザワヒリは、数百人の死者を出したテロ活動と、それに続く政府の弾圧により数千人が投獄された事態を終わらせるためにエジプトで組織されていた「非暴力イニシアチブ」について知った。ザワヒリはロンドンの新聞『アル＝シャルク・アル＝アウサト』への手紙の中で、この「降伏」に激しく反対した。彼はアル＝ガマーア・アル＝イスラーミーヤのメンバーと共に、政府を挑発して弾圧させることでこのイニシアチブを妨害するため、ハトシェプスト女王葬祭殿で観光客に対する大規模な攻撃を組織した。警察の制服を着た6人によるこの攻撃は、58人の外国人観光客と4人のエジプト人を銃撃および殺害することに成功した。
12ザワヒリによるエジプト・イスラム・ジハードのアルカイダへの正式合併
1998年、ザワヒリはエジプト・イスラム・ジハードをアルカイダに正式に合併させた。元アルカイダメンバーの報告によると、彼はアルカイダ組織の設立当初から活動しており、グループのシューラ評議会の幹部であった。彼はしばしばオサマ・ビンラディンの「副官」と評されたが、ビンラディンが選んだ伝記作家は彼をアルカイダの「真の頭脳」と呼んでいる。
13ユダヤ人と十字軍に対する世界イスラム戦線
1998年2月23日、ザワヒリはオサマ・ビンラディンと共に「ユダヤ人と十字軍に対する世界イスラム戦線」というタイトルで共同ファトワを発した。このファトワの実際の起草者はビンラディンではなく、ザワヒリであったと考えられている。
14アルカイダ会議
ビンラディンとザワヒリは1998年6月24日にアルカイダ会議を組織した。会議開始の1週間前、ザワヒリの武装した側近グループがジープでヘラート方面へ向かった。彼らは後援者の指示に従い、コー・イ・ドシャクの町で、イラン経由でロシアから到着した3人の正体不明のスラブ系の男たちと会った。カンダハールに到着後、彼らは別行動をとった。ロシア人のうち1人はザワヒリの元へ直接護送され、会議には参加しなかった。
15アイマン・ザワヒリが米国で起訴される
1998年、アイマン・ザワヒリは、1998年の米国大使館爆破事件における役割により、米国で起訴された。この一連の攻撃は1998年8月7日に発生し、タンザニアのダルエスサラームとケニアのナイロビにある米国大使館でトラック爆弾が同時に爆発し、数百人が死亡した。この攻撃により、オサマ・ビンラディンとアイマン・ザワヒリは国際的な注目を集めることとなった。
16ザワヒリに欠席裁判で死刑判決
ルクソール事件は非常に不評であったため、その後数年間エジプトではテロ攻撃が発生しなかった。ザワヒリは1999年、エジプトの軍事法廷で欠席裁判により死刑判決を受けた。
17アルバニアからの帰還者の事件
1990年代の対エジプト政府攻撃における主導的な役割により、アル・ザワヒリと弟のムハンマド・アル・ザワヒリは、1999年のエジプトにおける「アルバニアからの帰還者」裁判で死刑判決を受けた。
18米海軍コール襲撃事件
2000年10月12日の米海軍コール襲撃事件を受け、数名のメンバーが離脱した。モハメド・アテフはカンダハルから脱出し、ザワヒリはカブールへ、ビンラディンもカブールへ逃亡した。ビンラディンは、アメリカによる報復攻撃がないと悟ると、後にアテフと合流した。
19米軍のアフガニスタン侵攻
米軍のアフガニスタン侵攻後、アル・ザワヒリの所在は不明だが、一般的にはパキスタンの部族地域にいると考えられている。彼は頻繁に自身のビデオを公開しているが（「アイマン・アル・ザワヒリのメッセージ」を参照）、2003年以降、ビンラディンと並んで登場することはなかった。しかし、一連の作戦にもかかわらず、彼を捕らえることはできなかった。
20最重要指名手配テロリスト22人
2001年10月10日、アル・ザワヒリは、ジョージ・W・ブッシュ米大統領によって公表された、米連邦捜査局（FBI）の「最重要指名手配テロリスト22人」の最初のリストに掲載された。
21アフガニスタン市民権
2001年11月初旬、タリバン政権は、彼およびビンラディン、モハメド・アテフ、サイフ・アル・アデル、シャイフ・アシム・アブドゥルラフマンに対して、公式にアフガニスタン市民権を付与すると発表した。
22アッザの死
アイマン・アル・ザワヒリの最初の妻アッザと、6人の子供のうちの2人であるモハンマドとアイシャは、米国での9.11テロ攻撃を受けて2001年12月下旬に行われた米軍によるアフガニスタン空爆で死亡した。ガルデズにあるタリバン支配下の建物への米軍の空爆後、アッザはゲストハウスの屋根の瓦礫の下敷きになった。
23ダマドラ空爆
2006年1月13日、中央情報局（CIA）はパキスタンISIの支援を受け、アル・ザワヒリが潜伏していると見られたアフガニスタン国境近くのパキスタンの村、ダマドラを空爆した。この空爆はアル・ザワヒリを殺害することを目的としており、その後の数日間、国際ニュースで報じられた。空爆の犠牲者の多くは身元確認されないまま埋葬された。米政府の匿名当局者は、数人のテロリストが殺害されたと主張し、バジャウル部族地域の政府は、少なくとも4人のテロリストが死者の中に含まれていることを確認した。
24空爆に関するアル・ザワヒリのビデオ
国内各地で反米抗議デモが発生し、パキスタン政府は米国の攻撃と罪のない人々の犠牲を非難した。1月30日、アル・ザワヒリが無傷であることを示す新しいビデオが公開された。ビデオでは空爆について言及されたが、当時アル・ザワヒリが村にいたかどうかは明らかにされなかった。
25アル・ザワヒリがパキスタン政府に対して過激な行動をとった最初の確認事例
2007年7月、アル・ザワヒリは「オペレーション・サイレンス（沈黙作戦）」というコードネームで知られるラル・マスジド（赤いモスク）包囲戦の指揮を執った。これは、アル・ザワヒリがパキスタン政府に対して過激な行動をとり、パキスタン国家に対してイスラム過激派を指導したことが確認された最初の事例である。イスラマバードのラル・マスジドを制圧したパキスタン軍と特殊部隊は、モスクと隣接するマドラサを運営していたイスラム過激派のアブドゥル・ラシード・ガジとアブドゥル・アジズ・ガジに対し、アル・ザワヒリが指示を出していた手紙を発見した。この衝突により100人が死亡した。
26パキスタン元首相暗殺事件
2007年12月27日、アル・ザワヒリはパキスタンのベナジル・ブット元首相の暗殺にも関与したとされている。
27アルカイダの最高司令官としての台頭
2009年4月30日、米国務省は、アル・ザワヒリがアルカイダの作戦および戦略司令官として台頭し、オサマ・ビンラディンは組織のイデオロギー的な象徴に過ぎなくなったと報告した。しかし、2011年のビンラディン死亡後、米国の高官は、急襲で収集された情報により、ビンラディンが計画に深く関与し続けていたことが示されたと述べた。「アボタバードにあるこの拠点（ビンラディンが殺害された場所）は、アルカイダ指導者の活発な指揮統制センターだった。彼は作戦計画やアルカイダ内の戦術的決定を主導する上で活動的だった。」
28オサマ・ビンラディン死亡後初のアル・ザワヒリのビデオ
2011年6月8日、アル・ザワヒリはオサマ・ビンラディン死亡後初となるビデオを公開し、ビンラディンを称賛し米国に報復攻撃を警告したが、アルカイダの指導権を主張することはなかった。
29アルカイダの指導者
2011年5月2日、オサマ・ビンラディンの死亡に伴い、彼はアルカイダの指導者となった。これは6月16日のアルカイダ総司令部によるプレスリリースで確認された。アル・ザワヒリのアルカイダ指揮権継承は、2011年6月16日に彼らの複数のウェブサイトで発表された。同日、アルカイダはイスラエルを非合法国家とし、パレスチナに関するいかなる妥協も受け入れないという立場を改めて表明した。
30インド亜大陸のアルカイダ
2014年9月3日、アル・ザワヒリは55分間のビデオの中で、「その土地を解放し、主権を回復し、カリフ制を復活させる」ためにジハードを行う「インド亜大陸のアルカイダ（AQIS）」という新しい組織の結成を発表した。この新組織の結成に対するインドのイスラム教徒の反応は激怒であった。