1誕生
ムハンマド・アリーは、オスマン帝国のルメリア州マケドニア地方カヴァラ（現在のギリシャの都市）で、コルチャ出身のアルバニア人一家に生まれた。彼は、カヴァラでオスマン帝国の小部隊の指揮官も務めたアルバニア人のタバコ・海運商人イブラヒム・アーガーの次男であった。
2ボルクバシ
彼の母親は、「カヴァラのアーヤーン（有力者）」であったチョルバジュ・フセイン・アーガーの娘、ゼイネブである。父親が若くして亡くなると、ムハンマドは叔父に引き取られ、従兄弟たちと共に育てられた。ムハンマド・アリーの勤勉さへの報酬として、叔父は彼にカヴァラの町での徴税を行う「ボルクバシ（分隊長）」の地位を与えた。
3アミナとの結婚
ムハンマド・アリーは後に、裕福な未亡人であった従姉妹のアミナ・ハニムと結婚した。彼女はアリー・アーガーとカドリイェ（ゼイネブの姉妹）の娘であった。
4エジプトへの派遣
1801年、彼の部隊は、エジプトの生活様式を脅かした短期間のフランス占領を経てエジプトを再占領するため、より大規模なオスマン帝国軍の一部として派遣された。ゼベック船からなる遠征隊は、1801年春にアブキールに上陸した。
彼の信頼する軍司令官の一人に、ムハンマドの姉妹ズバイダと結婚し、ヤカン家の祖先となったミラライ・ムスタファ・ベイがいる。
5エジプトの指導者ウマル・マクラムとの同盟
紛争が長引くにつれ、地元住民は権力争いに疲れ果てていた。1801年、彼はエジプトの指導者ウマル・マクラムおよびアル＝アズハルの大イマームと同盟を結んだ。1801年から1805年にかけてのオスマン帝国とマムルーク間の内紛の間、ムハンマド・アリーは世論の支持を得るために慎重に行動した。
6交代の要求
1805年、ウラマー（学者、知識人）に率いられたエジプトの有力者グループが、ワーリー（総督）フルシド・アフマド・パシャをムハンマド・アリーに交代させるよう要求し、オスマン帝国側はこれに応じた。
7ムハンマド・アリーによるヒジャーズ地方の占領
ムハンマド・アリーの最初の軍事作戦は、アラビア半島への遠征であった。聖地メッカとメディナは、イスラム教のハンバリー学派の文字通りの解釈を信奉するサウード家によって占領されていた。
新たな宗教的熱意を武器に、サウード家はアラビアの一部を征服し始めた。これが1805年までのヒジャーズ地方の占領につながった。
8セリム3世の廃位と殺害
セリム3世（在位1789年–1807年）は、国家の競争力を維持するために、オスマン帝国軍をヨーロッパ式に改革・近代化する必要性を認識していた。しかし、セリム3世は、既得権益を持つ聖職者や軍事機構、特にイェニチェリからの根強い反対に直面した。
その結果、セリム3世は1808年に廃位され、最終的に殺害された。
9アリーによるマクラムのダミエッタへの追放
しかし1809年、アリーはマクラムをダミエッタへ追放した。アブドゥル・ラフマーン・アル＝ジャバルティーによれば、マクラムはムハンマド・アリーが自ら権力を掌握しようとする意図を見抜いていたという。
10国有化
彼の最初の任務は、エジプトの歳入源を確保することであった。これを達成するため、ムハンマド・アリーはエジプトのすべてのイルティザーム（徴税権）地を「国有化」し、土地の全生産物を公式に所有した。彼は、それまでエジプト全土の土地を所有していた「徴税請負人」への増税を行うことで、国家による財産の併合を成し遂げた。
新しい税率は意図的に高く設定され、徴税請負人が土地を耕作する農民から要求された支払いを徴収できなくなると、ムハンマド・アリーは彼らの財産を没収した。
11マムルークの虐殺
ムハンマド・アリーは、アラビアへの軍事遠征を率いることになった息子のトゥスン・パシャを称える祝宴に、マムルークの指導者たちをカイロのシタデルに招待した。このイベントは1811年3月1日に開催された。マムルークたちがシタデルに集まったところで、彼らはムハンマド・アリーの軍隊に包囲され、殺害された。
12アブドゥッラー・イブン・サウードのイスタンブール送還と処刑
遠征は成功したものの、サウード家の力は完全に打ち砕かれたわけではなかった。彼らは半島の中心部ナジュド地方からオスマン帝国軍とエジプト軍を悩ませ続けた。
その結果、ムハンマド・アリーは別の息子イブラヒムを軍の指揮官として派遣し、サウード家を最終的に撃退させた。
その後、サウード家は壊滅し、一族の大部分が捕らえられた。一族の指導者アブドゥッラー・イブン・サウードはイスタンブールに送られ、処刑された。
13ブラク印刷所
1819年から1821年にかけて、彼の政府はアラブ世界初の先住民による印刷所であるブラク印刷所を設立した。ブラク印刷所は、ムハンマド・アリー政府の官報を発行した。
14ムハンマド・アリーによる5,000人の軍隊のスーダン派遣
1820年、ムハンマド・アリーは、領土を征服し自らの権威に従わせる目的で、三男イスマイルとアビディン・ベイが指揮する5,000人の軍隊を南のスーダンへ派遣した。
15ギリシャ独立戦争
ムハンマド・アリーがアフリカへ権威を拡大している間、オスマン帝国はヨーロッパ領土での民族反乱に直面していた。オスマン帝国のギリシャ諸州での反乱は1821年に始まった。
オスマン帝国軍は、コンスタンティノープルにまで民族間の暴力が広がる中、反乱を鎮圧しようと試みたが効果はなかった。自軍の無力さを悟ったスルタン・マフムト2世は、反乱鎮圧の支援と引き換えに、ムハンマド・アリーにクレタ島を提供した。
16スーダン征服
アリーの軍隊は1821年にスーダンへ進軍したが、シャイギーヤ族の激しい抵抗に遭った。最終的には、エジプト軍の優位性と火器によってシャイギーヤ族は敗北し、その後のスーダン征服が確定した。
17ナフダ
1820年代、ムハンマド・アリーはエジプト人学生からなる最初の教育「使節団」をヨーロッパに派遣した。この接触により、ナフダとして知られるアラブ文学復興の夜明けと見なされる文学が生まれた。
18ムハンマド・アリーによるカスル・アル＝アイニー医学学校の設立
クロット・ベイは1827年、ムハンマド・アリーに招かれ、アブー・ザアバル陸軍病院にカスル・アル＝アイニー医学部を設立した。同校は後にカイロへ移転した。
19ナヴァリノの海戦
ムハンマド・アリーは息子のイブラーヒーム・パシャの指揮下、1万6000人の兵士と63隻の護衛艦を派遣した。イギリス、フランス、ロシアはギリシャの革命勢力を保護するために介入した。
1827年10月20日のナヴァリノの海戦において、オスマン帝国の代表であるムハッラム・ベイの指揮下にあったエジプト海軍は、エドワード・コドリントン提督率いる欧州連合艦隊によって全滅させられた。
20ムハンマド・アリーがオスマン朝にシリア領土を要求
ナヴァリノでの敗北の代償として、ムハンマド・アリーはオスマン朝（崇高なる門）にシリアの領土を要求した。オスマン側はこの要求に対して無関心であり、スルタン自身も、もしシリアを譲り渡した後にムハンマド・アリーが廃位されたらどうなるのかと冷ややかに問い返した。
しかし、ムハンマド・アリーはもはやオスマン側の無関心を容認するつもりはなかった。自身とエジプトの損失を補うため、シリア征服への動きが開始された。
21最初の刑法
この法律の目的は、ムハンマド・アリーの不在時に彼を代理することであった。ムハンマド・アリーは、エジプト国内の犯罪をより効果的に抑制することを目指し、法制度の改革に着手した。特に1829年には、国民に対する支配力を強めるため、最初の刑法を制定した。
22法と秩序の状態
この頃には、ムハンマド・アリーはすでに独立国家の樹立に向けて動いており、1830年には「法と秩序」の状態を作り出すことでそれを表明した。これはエジプト国内のキリスト教徒が安全に暮らせるようにするものであり、ムハンマド・アリーがヨーロッパからの影響力を引き出す手段でもあった。
彼はスルタンよりも自身が政府に対して強い影響力を持てるよう、政府の改革を徐々に進めた。カイロやアレクサンドリアで特に知られる警察組織を導入し、それは単なる法執行機関としてだけでなく、検察庁のような役割も果たした。
23兵器生産
その結果、彼は兵器生産に注力した。カイロに拠点を置く工場ではマスケット銃や大砲が製造された。また、アレクサンドリアに造船所を建設し、海軍の構築を開始した。
1830年代末までには、エジプトの軍需産業は100門の砲を備えた軍艦を9隻建造し、月産1,600挺のマスケット銃を生産するまでになっていた。
24エジプトのシリア侵攻
新たな艦隊が建造され、新たな軍隊が編成された。1831年10月31日、イブラーヒーム・パシャ率いるエジプト軍のシリア侵攻により、第一次エジプト・トルコ戦争が勃発した。
世界舞台での体裁を整えるため、侵攻の口実が不可欠であった。
25エジプト軍が最終的にアッコを占領
エジプト軍はシリアとその背後地の大部分を容易に制圧した。唯一、真に重要な抵抗を示したのは港湾都市アッコであった。
エジプト軍は1831年11月3日から1832年5月27日まで続いた6ヶ月間の包囲戦の末、ついに同市を占領した。
包囲戦の期間中、エジプト国内の情勢不安は劇的に高まった。
アリーは軍事作戦を維持するためにエジプトへの締め付けを強めざるを得ず、国民はその負担増に反発した。
26女子医学校
1832年、ムハンマド・アリーは、エジプトで「クロット・ベイ」として知られるアントワーヌ・クロットに対し、女子医学校の設立を許可した。
27コンヤの戦い
アッコの陥落後、エジプト軍は北上してアナトリアへ侵攻した。コンヤの戦い（1832年12月21日）において、イブラーヒーム・パシャはサドラザム（大宰相）レシド・パシャ率いるオスマン軍を完膚なきまでに打ち破った。これにより、イブラーヒームの軍勢とコンスタンティノープルの間には、もはや軍事的な障害は存在しなくなった。
28キュタヒヤ条約
ロシアの台頭はイギリスとフランスの政府を狼狽させ、直接介入を招いた。この状況下で、欧州列強は1833年5月にキュタヒヤ条約として知られる交渉による解決を仲介した。
和平条件は、アリーがアナトリアから軍を撤退させる代わりに、代償としてクレタ島（当時はカンディアと呼ばれた）とヒジャーズの領土を獲得し、イブラーヒーム・パシャがシリアのワーリー（知事）に任命されるというものであった。しかし、この和平合意はムハンマド・アリーに独立王国を与えるまでには至らず、彼を満足させるものではなかった。
29フンキャール・イスケレシ条約
こうした動きにもかかわらず、ムハンマド・アリーの目標は現在のオスマン帝国のスルタン、マフムト2世を退位させ、その息子の幼いアブデュルメジトを即位させることにあった。この可能性に危機感を抱いたマフムト2世は、ロシアの軍事援助の申し出を受け入れ、フンキャール・イスケレシ条約が締結された。
30ムハンマド・アリーがイギリスとフランスに対し、オスマン帝国からの独立を宣言する意向を伝達
1838年5月25日、ムハンマド・アリーはイギリスとフランスに対し、オスマン帝国からの独立を宣言する意向を伝えた。この行動は、オスマン帝国内の現状維持を望む欧州列強の意向に反するものであった。ムハンマド・アリーの意図が明らかになると、欧州列強、特にロシアは事態を沈静化させ、紛争を防ごうと試みた。
しかし帝国内部では、双方が戦争の準備を進めていた。イブラーヒームはすでにシリアにかなりの兵力を有していた。
コンスタンティノープルでは、オスマン軍の司令官ハフィズ・パシャが、エジプト軍を撃破できるとスルタンに請け合っていた。
31ネズィブの戦い
マフムト2世がシリア国境への進軍を命じると、イブラーヒームはウルファ近郊のネズィブの戦い（1839年6月24日）でこれを攻撃し、壊滅させた。コンヤの戦いの再現のように、コンスタンティノープルは再びアリーの軍勢に対して脆弱な状態となった。
オスマン帝国にとってさらなる打撃となったのは、艦隊がムハンマド・アリー側に寝返ったことであった。
マフムト2世は戦いの直後に急死し、16歳のアブデュルメジトが後を継いだ。
この時点で、アリーとイブラーヒームは今後の方針をめぐって対立し始めた。イブラーヒームはオスマン帝国の首都を征服して帝位を要求することを主張したが、ムハンマド・アリーは自身と家族のために領土の割譲と政治的自治を要求するにとどめる考えであった。
32ムハンマド・アリーが同意
この時点で、欧州列強が再び介入した。1840年7月15日、オーストリア、プロイセン、ロシアと交渉してロンドン条約に調印したイギリス政府は、ムハンマド・アリーに対し、シリア内陸部とレバノン山脈の沿岸地域から撤退することを条件に、オスマン帝国の一部としてのエジプトの世襲統治を提案した。ムハンマド・アリーはフランスの支援があると信じて躊躇した。
この躊躇は高くついた。ルイ・フィリップ国王は、特にライン危機にも対処しなければならない時期に、自国が他の列強との戦争に巻き込まれ孤立することを望まなかったため、フランスは最終的に手を引いた。イギリス海軍はシリアとアレクサンドリアへの出航を命じられた。
欧州の軍事力の誇示を前に、ムハンマド・アリーは黙認した。ムハンマド・アリーは最終的に1840年11月27日に条約を受け入れざるを得なかった。
33ムハンマド・アリーの精神は次第に混濁していった
シリアでの失敗と、エジプト政府に輸入障壁の撤廃と独占権の放棄を強いたバルタ・リマン条約の直後である1843年以降、ムハンマド・アリーの精神は次第に混濁し、被害妄想の傾向が見られるようになった。
それが純粋な老衰によるものか、それとも数年前に赤痢の治療のために投与された硝酸銀の影響によるものかは、今なお議論の対象となっている。
34ワリーは1848年まで統治した
リウマチの痛みと結核（喀血が始まっていた）で次第に体が不自由になったイブラーヒームは、湯治のためにイタリアへ送られ、ムハンマド・アリーは1846年にコンスタンティノープルへ旅立った。
そこで彼はスルタンに接近し、自身の懸念を表明して和解し、次のように説明した。「（息子の）イブラーヒームは老いて病弱であり、（孫の）アッバースは怠惰だ。その後は子供たちがエジプトを統治することになるだろう。
彼らはどうやってエジプトを守るというのか？」家族の世襲統治を確保した後、ワリーは1848年まで統治したが、老衰によりこれ以上の統治は不可能となった。
35死
この頃には、ムハンマド・アリーは非常に病弱で老衰が進んでいたため、息子の死を知らされることはなかった。さらに数ヶ月持ちこたえたが、ムハンマド・アリーは1849年8月2日、アレクサンドリアのラス・エル・ティン宮殿で死去し、最終的にカイロのシタデルに彼が建設を命じた壮大なモスクに埋葬された。