Do 17 grudnia rebelia została powstrzymana i złamana. Około 40 rebeliantów zginęło, a 3400 zostało schwytanych. Reszta uciekła i przypuszczano, że próbują dotrzeć do Indonezji. Spośród przywódców, Azahari przebywał na Filipinach, a Yassin Affendi był wśród zbiegów.