Началась Гражданская война в США
Когда началась Гражданская война в США, сестры Блэкуэлл помогали в организации сестринского дела. Блэкуэлл сильно симпатизировала Северу из-за своих аболиционистских корней и даже заявляла, что покинула бы страну, если бы Север пошел на компромисс в вопросе рабства. Однако Блэкуэлл столкнулась с сопротивлением со стороны доминирующей в мужской среде Санитарной комиссии Соединенных Штатов (USSC). Врачи-мужчины отказывались помогать с планом обучения медсестер, если в нем участвовали сестры Блэкуэлл. В ответ на действия USSC Блэкуэлл организовала Женскую центральную ассоциацию помощи (WCRA). WCRA боролась с проблемой нескоординированной благотворительности, но в конечном итоге была поглощена USSC. Тем не менее, Нью-Йоркской больнице удалось наладить сотрудничество с Доротеей Дикс для подготовки медсестер для нужд Союза.