Füze açığı
Kennedy 1960'ta başkanlık için aday olduğunda, seçimdeki temel konularından biri Sovyetlerle olan iddia edilen "füze açığı" idi.

Salı Eki 16, 1962 e Pazartesi Eki 29, 1962
Cuba
1962 Ekim Krizi, Karayip Krizi veya Füze Korkusu olarak da bilinen Küba Füze Krizi, Amerika Birleşik Devletleri ile Sovyetler Birliği arasında 35 gün süren ve Amerika'nın İtalya ve Türkiye'ye füze yerleştirmesine karşılık Sovyetlerin Küba'ya benzer balistik füzeler yerleştirmesiyle uluslararası bir krize dönüşen bir çatışmadır.
Kennedy 1960'ta başkanlık için aday olduğunda, seçimdeki temel konularından biri Sovyetlerle olan iddia edilen "füze açığı" idi.
1961'de Amerika, Sovyetlerin sadece dört adet R-7 Semyorka kıtalararası balistik füzeye (ICBM) sahip olduğunu keşfetti.
SSCB, Batı Berlin'deki Batılı silahlı kuvvetler de dahil olmak üzere tüm silahlı kuvvetlerin Berlin'den çekilmesini talep eden bir ültimatom yayınladı. Kriz, Doğu Almanya'nın Berlin Duvarı'nı inşa etmesiyle şehrin fiilen bölünmesiyle sonuçlandı.
1961'in sonlarında Fidel Castro, Sovyetler Birliği'nden daha fazla SA-2 uçaksavar füzesi istedi. Talep, Sovyet liderliği tarafından işleme konulmadı.
1962'nin başlarında, bir grup Sovyet askeri ve füze inşa uzmanı, bir tarım heyetine eşlik ederek Havana'ya gitti.
Ocak 1962'de ABD Ordusu Generali Edward Lansdale, Kennedy'ye ve Mongoose Operasyonu ile ilgili yetkililere hitaben yazılan çok gizli bir raporda (1989'da kısmen gizliliği kaldırıldı) Küba hükümetini devirme planlarını açıkladı.
Timothy Naftali, Escalante'nin görevden alınmasının, Sovyetlerin 1962'de Küba'ya nükleer füze yerleştirme kararının arkasındaki motive edici bir faktör olduğunu savundu.
Şubat 1962'de ABD, Küba'ya karşı bir ambargo başlattı ve Lansdale, Küba hükümetinin devrilmesinin uygulanması için 26 sayfalık çok gizli bir zaman çizelgesi sundu.
Mayıs 1962'de Sovyet Birinci Sekreteri Nikita Kruşçev, Sovyet orta menzilli nükleer füzelerini Küba'ya yerleştirerek ABD'nin stratejik füze geliştirme ve konuşlandırmadaki artan liderliğine karşı koyma fikrine ikna oldu.
Mayıs ayına gelindiğinde Kruşçev ve Castro, Küba'ya gizlice stratejik nükleer füzeler yerleştirme konusunda anlaştılar.
Temmuz ayında "makine operatörleri", "sulama uzmanları" ve "tarım uzmanları" kılığında füze inşa uzmanları Küba'ya ulaştı.
CIA direktörü John A. McCone şüpheleniyordu. Küba'ya uçaksavar füzeleri göndermenin, "ancak Moskova bunları Amerika Birleşik Devletleri'ni hedef alan balistik füzeler için bir üssü korumak amacıyla kullanmayı amaçlıyorsa mantıklı olacağını" düşündü. 10 Ağustos'ta Kennedy'ye, Sovyetlerin Küba'ya balistik füze yerleştirmeye hazırlandığını tahmin ettiği bir not yazdı.
Keşif uçuşlarında duraklamaya yol açan ilk sorun, 30 Ağustos'ta ABD Hava Kuvvetleri'nin Stratejik Hava Komutanlığı tarafından işletilen bir U-2'nin yanlışlıkla Sovyet Uzak Doğusu'ndaki Sahalin Adası üzerinde uçmasıyla meydana geldi.
31 Ağustos'ta Senatör Kenneth Keating (R-New York), Senato kürsüsünde Sovyetler Birliği'nin "büyük olasılıkla" Küba'da bir füze üssü inşa ettiği konusunda uyardı. Kennedy yönetimini ABD'ye yönelik büyük bir tehdidi örtbas etmekle suçladı ve böylece krizi başlattı.
Eylül 1962'de Savunma İstihbarat Ajansı (DIA) analistleri, Küba'daki karadan havaya füze sahalarının, Sovyetler Birliği tarafından ICBM üslerini korumak için kullanılanlara benzer bir düzende düzenlendiğini fark ettiler ve bu durum DIA'nın ada üzerinde U-2 uçuşlarının yeniden başlatılması için lobi yapmasına yol açtı.
İlk Sovyet R-12 füze sevkiyatı 8 Eylül gecesi, ikincisi ise 16 Eylül'de ulaştı. R-12, termonükleer savaş başlığı taşıyabilen orta menzilli bir balistik füzeydi.
15 Ekim'de CIA'in Ulusal Fotoğrafik Yorumlama Merkezi (NPIC), U-2 fotoğraflarını inceledi ve orta menzilli balistik füzeler olarak yorumladıkları nesneleri tanımladı.
17 Ekim'de Sovyet büyükelçiliği yetkilisi Georgy Bolshakov, Başkan Kennedy'ye Kruşçev'den "hiçbir koşulda Küba'ya karadan karaya füzelerin gönderilmeyeceği" konusunda güvence veren kişisel bir mesaj getirdi.
19 Ekim'de EXCOMM, hava saldırısı ve abluka seçeneklerini incelemek için ayrı çalışma grupları oluşturdu ve öğleden sonra EXCOMM'daki desteğin çoğu abluka seçeneğine kaydı.
Kennedy, 21 Ekim boyunca EXCOMM üyeleri ve diğer üst düzey danışmanlarla bir araya gelerek kalan iki seçeneği değerlendirdi: öncelikle Küba füze üslerine yönelik bir hava saldırısı veya Küba'nın deniz ablukası.
22 Ekim saat 19:00 EDT'de Kennedy, tüm büyük ağlarda yayınlanan ulusal bir televizyon konuşmasıyla füzelerin keşfini duyurdu.
Saat 22:00 EDT'de ABD, SAC kuvvetlerinin hazırlık seviyesini DEFCON 2'ye yükseltti. ABD tarihinde ilk ve tek onaylanmış kez, B-52 bombardıman uçakları sürekli havada alarm durumuna geçti ve B-47 orta menzilli bombardıman uçakları çeşitli askeri ve sivil havaalanlarına dağıtılarak 15 dakika içinde tam donanımlı olarak havalanmaya hazır hale getirildi.
27 Ekim Cumartesi günü, Sovyetler Birliği ile Kennedy'nin kabinesi arasında yapılan uzun görüşmelerin ardından Kennedy, Kruşçev'in Küba'daki tüm füzeleri kaldırması karşılığında, Türkiye'de ve muhtemelen Güney İtalya'da konuşlandırılmış tüm füzelerin (ilki Sovyetler Birliği sınırındaydı) kaldırılmasını gizlice kabul etti.
1962'deki Sovyet nükleer kapasitesi, kıtalararası balistik füzelerden (ICBM) ziyade orta ve orta menzilli balistik füzelere (MRBM ve IRBM) daha az önem veriyordu.