查士丁尼于529年关闭了新柏拉图学院

尽管自4世纪君士坦丁大帝时代以来，多神教一直受到国家的压制，但传统的希腊罗马文化在6世纪的东罗马帝国仍然具有影响力。 希腊化哲学开始逐渐融入较新的基督教哲学。约翰·菲洛波努斯等哲学家除了基督教思想和经验主义外，还借鉴了新柏拉图主义的观点。由于其教授们积极信奉异教，查士丁尼于529年关闭了新柏拉图学院。 其他学校在君士坦丁堡、安条克和亚历山大港继续存在，这些城市是查士丁尼帝国的中心。

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