马丁·路德发起了后来被称为宗教改革的运动

除了西班牙和德国遗产之间的冲突外，宗教冲突也是查理五世统治期间紧张局势的另一个来源。在查理在神圣罗马帝国的统治开始之前，1517年，马丁·路德发起了后来被称为“宗教改革”的运动。当时，许多地方公爵将其视为反对皇帝查理五世霸权的机会。帝国随后沿着宗教路线发生了致命的分裂，北部、东部以及许多主要城市——斯特拉斯堡、法兰克福和纽伦堡——转变为新教，而南部和西部地区则主要保持天主教信仰。

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