تم تنظيم الإبادة الجماعية من قبل أعضاء النخبة السياسية الأساسية من الهوتو، وشغل العديد منهم مناصب على أعلى المستويات في الحكومة الوطنية. يتفق معظم المؤرخين على أن الإبادة الجماعية ضد التوتسي قد تم التخطيط لها لمدة عام على الأقل. ومع ذلك، أدى اغتيال الرئيس الرواندي جوفينال هابياريمانا في 6 أبريل 1994 إلى فراغ في السلطة وأنهى اتفاقات السلام. بدأت أعمال القتل الجماعي في اليوم التالي عندما قام الجنود والشرطة والميليشيات بإعدام زعماء سياسيين وعسكريين من قبيلة التوتسي ومعتدلين من الهوتو.
بعد وفاة هابياريمانا، في مساء يوم 6 أبريل، تم تشكيل لجنة للأزمة. وتألفت من اللواء أوغستين ندينديلييمانا، والعقيد تيونيست باغوسورا، وعدد من كبار ضباط الأركان الآخرين. وترأس باغوسورا اللجنة، على الرغم من وجود ندينديلييمانا الأعلى رتبة. كانت رئيسة الوزراء أجاث أولينجييمانا هي التالية من الناحية القانونية في خط الخلافة السياسية، لكن اللجنة رفضت الاعتراف بسلطتها. التقى روميو دالير باللجنة في تلك الليلة وأصر على تكليف أولينجييمانا بالمسؤولية، لكن باغوسورا رفض، قائلاً إن أولينجييمانا "لا تتمتع بثقة الشعب الرواندي" وإنها "غير قادرة على حكم الأمة". كما بررت اللجنة وجودها بأنه ضروري لتجنب عدم اليقين بعد وفاة الرئيس. سعى باغوسورا لإقناع بعثة الأمم المتحدة لتقديم المساعدة إلى رواندا والجبهة الوطنية الرواندية بأن اللجنة تعمل على احتواء الحرس الرئاسي، الذي وصفه بأنه "خارج عن السيطرة"، وأنه سيلتزم باتفاق أروشا.
في 7 أبريل، مع بدء الإبادة الجماعية، حذر قائد الجبهة الوطنية الرواندية بول كاغامي لجنة الأزمة وبعثة الأمم المتحدة لتقديم المساعدة إلى رواندا من أنه سيستأنف الحرب الأهلية إذا لم يتوقف القتل.
لجأ الآلاف إلى المدرسة الفنية الرسمية (المدرسة الفنية الرسمية) في كيغالي حيث كان يتمركز جنود بعثة الأمم المتحدة لتقديم المساعدة إلى رواندا البلجيكيين. في 11 أبريل، انسحب الجنود البلجيكيون، وقتلت القوات المسلحة والميليشيات الرواندية جميع التوتسي.
في 12 أبريل، أعلنت الحكومة البلجيكية، التي كانت من أكبر المساهمين بقوات في بعثة الأمم المتحدة لتقديم المساعدة إلى رواندا، وفقدت عشرة جنود يحمون رئيسة الوزراء أولينجيلييمانا، انسحابها، مما قلل من فعالية القوة بشكل أكبر.
اتفاق مراكش، الذي تجلى في إعلان مراكش، كان اتفاقًا تم توقيعه في مراكش، المغرب، من قبل 123 دولة في 15 أبريل 1994، إيذانًا بتتويج جولة أوروغواي التي استمرت 8 سنوات وإنشاء منظمة التجارة العالمية، والتي دخلت رسميًا في يجري في 1 يناير 1995.
عانى نيكسون من سكتة دماغية حادة في 18 أبريل 1994 ، بينما كان يستعد لتناول العشاء في منزله في بارك ريدج ، نيو جيرسي. تشكلت جلطة دموية ناتجة عن الرجفان الأذيني الذي عانى منه لسنوات عديدة في الجزء العلوي من قلبه ، وانقطعت وانتقلت إلى دماغه. تم نقله إلى مستشفى نيويورك - مركز كورنيل الطبي في مانهاتن ، في البداية في حالة تأهب ولكنه غير قادر على الكلام أو تحريك ذراعه اليمنى أو ساقه. تسبب الضرر الذي لحق بالمخ في تورم (وذمة دماغية) ، وانزلق نيكسون في غيبوبة عميقة.
حوالي 29 أبريل 1994 ، تعرضت الوحدة الدنماركية (نوردبات 2) في مهمة حفظ السلام في البوسنة ، كجزء من كتيبة الشمال التابعة لقوة الحماية التابعة للأمم المتحدة الموجودة في توزلا ، لكمين أثناء محاولتها إخلاء نقطة مراقبة سويدية (تانجو 2) تعرضت لنيران المدفعية الثقيلة من قبل القوات المسلحة. لواء صرب البوسنة تشيكوفيتشي في قرية كاليسيا.