توفي مارلي في 11 مايو 1981 في مستشفى الأرز اللبناني في ميامي (الآن مستشفى جامعة ميامي) عن عمر يناهز 36 عامًا. تسبب انتشار سرطان الجلد في رئتيه ودماغه في وفاته. كانت كلماته الأخيرة لابنه زيغي "المال لا يشتري الحياة".
عندما دخل ساحة القديس بطرس لمخاطبة الجمهور في 13 مايو 1981، أصيب البابا يوحنا بولس الثاني بجروح خطيرة على يد محمد علي أغكا، وهو مسلح تركي خبير كان عضوًا في جماعة الذئاب الرمادية الفاشية.
تم إطلاق سراح بوفالينو في مايو عام 1981، ولكن تم اتهامه مرة أخرى، هذه المرة بالتآمر لقتل الشاهد ، نابولي.
قال شاهد الإثبات الرئيسي، جيمي فراتيانو، إن بوفالينو طلب منه هو ومايكل ريزيتيلو قتل نابولي في عام 1976.
تلقى مارلي جنازة رسمية في جامايكا في 21 مايو 1981 ، والتي جمعت بين عناصر من الأرثوذكسية الإثيوبية والتقاليد الراستافارية. تم دفنه في كنيسة صغيرة بالقرب من مسقط رأسه مع جيتاره ، وقام رئيس الوزراء الجامايكي إدوارد سيجا بتسليم تأبين جنازة مارلي