غادر باخ مولهاوزن عام 1708 ، وعاد إلى فايمار هذه المرة كعازف أرغن ومن عام 1714اصبح كونسرت ماستر (مدير الموسيقى) في المحكمة الدوقية، حيث أتيحت له فرصة العمل مع مجموعة كبيرة من الموسيقيين المحترفين جيدة التمويل.
في وقت لاحق من نفس العام، ولدت طفلتيهما الأولى ، كاتارينا دوروثيا ، وانضمت إليهما أخت ماريا باربرا الكبرى غير المتزوجة.
أنجب جوهان سيباستيان وماريا باربرا ثلاثة أطفال آخرين ، لكنهم لم يعيشوا حتى عيد ميلادهم الأول، بما في ذلك توأمان وُلدا عام 1713.
