في نهاية يونيو 1934، ألقي القبض على كبار المسؤولين في كتيبة العاصفة وعدد كبير من معارضي النظام، بما في ذلك غريغور ستراسر، وقتلوا في عملية تطهير أطلق عليها لاحقًا (ليلة السكاكين الطويلة). كان جوبلز حاضراً في عملية اعتقال قائد كتيبة العاصفة إرنست روم في ميونيخ.
