مع استمرار الصراع، سئم السكان المحليون من الصراع على السلطة. في عام 1801، تحالف مع الزعيم المصري عمر مكرم وإمام الأزهر الأكبر في مصر. خلال الاقتتال الداخلي بين العثمانيين والمماليك بين عامي 1801 و 1805، تصرف محمد علي بحذر لكسب دعم عامة الناس.
