تسببت الهجمات في مقتل 2,996 شخصًا (بما في ذلك جميع الخاطفين التسعة عشر) وإصابة أكثر من 6,000 آخرين. وشمل عدد القتلى 265 شخصًا من الطائرات الأربع (التي لم ينجُ منها أحد).
وكان معظم القتلى من المدنيين، باستثناء 343 رجل إطفاء، و 72 من ضباط إنفاذ القانون، و 55 عسكريًا، و 19 إرهابياً قتلوا في الهجمات.