دبر بن لادن الهجمات ونفى في البداية تورطه لكنه تراجع فيما بعد عن تصريحاته الكاذبة. وبثت قناة الجزيرة بيانا لابن لادن في 16 سبتمبر 2001 جاء فيه "أؤكد أنني لم أنفذ هذا العمل الذي يبدو أنه ارتكب من قبل أفراد بدوافعهم الخاصة".
