كانت محطة مركز التجارة العالمي تقع تحت المجمع. نتيجة لذلك، تم هدم المحطة بالكامل تمامًا عندما انهارت الأبراج، وغمرت المياه الأنفاق المؤدية إلى محطة اكسشينج بلاس في مدينة جيرسي، نيو جيرسي.
أعيد بناء المحطة كمركز نقل مركز التجارة العالمي بقيمة 4 مليارات دولار، والذي أعيد افتتاحه في مارس 2015.