كان باخ غائبا لمدة أربعة أشهر

على الرغم من الروابط العائلية القوية وصاحب العمل المتحمّس للموسيقى ، تصاعد التوتر بين باخ والسلطات بعد عدة سنوات في المنصب. كان باخ غير راضٍ عن مستوى المطربين في الجوقة. أطلق على أحدهم لقب "زيبيل فاجوتيست" (عازف الباسون الفاشل). في وقت متأخر من إحدى الأمسيات ، طارد هذا الطالب ، المسمى جيرسباخ ، باخ بعصا. قدم باخ شكوى ضد جيرسباخ لدى السلطات. لقد برأوا جيرسباخ بتوبيخ بسيط وأمروا باخ بأن يكون أكثر اعتدالًا فيما يتعلق بالصفات الموسيقية التي توقعها من طلابه. بعد بضعة أشهر، أزعج باخ صاحب العمل بسبب الغياب المطول عن ارنشتات: بعد حصوله على إجازة لمدة أربعة أسابيع ، كان غائبًا لمدة أربعة أشهر تقريبًا في 1705-1706 لزيارة عازف الأرغن والملحن ديتريتش بوكستهود في مدينة لوبيك الشمالية. تضمنت الزيارة إلى بوكستيهود رحلة طولها 450 كيلومترًا (280 ميلًا) ، سيرًا على الأقدام.