إن ارتباط دو بوا بالشيوعيين البارزين جعله مسئولاً عن الجمعية الوطنية للنهوض بالملونين ، خاصة وأن مكتب التحقيقات الفيدرالي كان قد بدأ في التحقيق بقوة مع المتعاطفين مع الشيوعيين. لذلك - بالاتفاق المتبادل - استقال من الجمعية الوطنية للنهوض بالملونين للمرة الثانية في أواخر عام 1948.