تزوج يونس من أفروزي يونس ، التي كانت آنذاك باحثًه في الفيزياء بجامعة مانشستر. تم تعيينها لاحقًا كأستاذة للفيزياء في جامعة جاهانجيرناغار. ولدت ابنتهما دينا افروز يونس عام 1986.