Bach war für etwa vier Monate abwesend
Trotz starker familiärer Verbindungen und eines musikalisch begeisterten Arbeitgebers bauten sich nach einigen Jahren im Amt Spannungen zwischen Bach und den Behörden auf. Bach war mit dem Niveau der Sänger im Chor unzufrieden. Er nannte einen von ihnen einen „Zippel Fagottist“. Spät an einem Abend verfolgte dieser Schüler namens Geyersbach Bach mit einem Stock. Bach reichte bei den Behörden Beschwerde gegen Geyersbach ein. Sie sprachen Geyersbach mit einer geringfügigen Rüge frei und wiesen Bach an, hinsichtlich der musikalischen Qualitäten, die er von seinen Schülern erwartete, maßvoller zu sein. Einige Monate später verärgerte Bach seinen Arbeitgeber durch eine längere Abwesenheit von Arnstadt: Nachdem er für vier Wochen Urlaub erhalten hatte, blieb er 1705–1706 etwa vier Monate lang weg, um den Organisten und Komponisten Dieterich Buxtehude in der nördlichen Stadt Lübeck zu besuchen. Der Besuch bei Buxtehude erforderte eine 450 Kilometer lange Reise in jede Richtung, Berichten zufolge zu Fuß.