Freshman

Zwischen Training, Spielen, Teambesprechungen und anderen Veranstaltungen investierte Hernandez fast das ganze Jahr über 40 bis 60 Stunden pro Woche in Football. Er sagte später, dass er jedes Mal, wenn er das Spielfeld betrat, unter Drogeneinfluss stand. Als Freshman startete Hernandez 2007 in drei Spielen für die Florida Gators. Er beendete die Saison mit neun Passfängen für 151 Yards und zwei Touchdowns. Obwohl er in seinem ersten Jahr glänzte, wurde er im Saisonauftakt seines zweiten Jahres aufgrund eines nicht bestandenen Drogentests auf die Bank gesetzt. Danach startete er in der Saison 2008 in elf von dreizehn Spielen anstelle des verletzten Cornelius Ingram und beendete die Saison mit 34 Passfängen für 381 Yards und fünf Touchdowns. Im BCS National Championship Game 2009 gegen die Oklahoma Sooners führte Hernandez die Gators mit 57 Yards bei fünf Passfängen an, als die Gators die Sooners mit 24–14 besiegten und ihre zweite BCS-Meisterschaft in drei Spielzeiten gewannen.

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