פרידריך השני קיסר האימפריה הרומית הקדושה
האפיפיור אינוקנטיוס השלישי, שחשש מהאיום שנשקף מאיחוד האימפריה וסיציליה, נתמך כעת על ידי פרידריך השני, שצעד לגרמניה והביס את אוטו. לאחר ניצחונו, פרידריך לא פעל לפי הבטחתו לשמור על שתי הממלכות נפרדות. אף שהמליך את בנו הנרי למלך סיציליה לפני הצעידה לגרמניה, הוא עדיין שמר לעצמו כוח פוליטי ממשי. זה נמשך לאחר שפרידריך הוכתר לקיסר בשנת 1220. מחשש מריכוז הכוח של פרידריך, הטיל האפיפיור לבסוף חרם על הקיסר. נקודת מחלוקת נוספת הייתה מסע הצלב, שפרידריך הבטיח אך דחה שוב ושוב.
