מ-996 עד 1006, כאשר רוב התפקידים הביצועיים של הח'ליף בוצעו על ידי יועציו, אל-חאכם השיעי "התנהג כמו הח'ליפים השיעים שקדמו לו, והפגין יחס עוין כלפי המוסלמים הסונים, בעוד שהיחס כלפי 'עמי הספר' – יהודים ונוצרים – היה של סובלנות יחסית, בתמורה לתשלום מס הג'יזיה.