Frederick II Kaisar Romawi Suci
Paus Innocentius III, yang takut akan ancaman yang ditimbulkan oleh penyatuan kekaisaran dan Sisilia, kini didukung oleh Frederick II, yang berbaris ke Jerman dan mengalahkan Otto. Setelah kemenangannya, Frederick tidak menepati janjinya untuk menjaga kedua wilayah tersebut tetap terpisah. Meskipun ia telah menjadikan putranya Henry sebagai raja Sisilia sebelum berbaris ke Jerman, ia tetap mencadangkan kekuasaan politik yang nyata untuk dirinya sendiri. Hal ini berlanjut setelah Frederick dinobatkan sebagai Kaisar pada tahun 1220. Karena takut akan konsentrasi kekuasaan Frederick, Paus akhirnya mengucilkan Kaisar. Poin perselisihan lainnya adalah perang salib, yang telah dijanjikan Frederick tetapi berulang kali ditunda.
