Alleato con il leader egiziano Umar Makram

Con il protrarsi del conflitto, la popolazione locale si stancò della lotta per il potere. Nel 1801, si alleò con il leader egiziano Umar Makram e con il Grande Imam di al-Azhar. Durante le lotte intestine tra ottomani e mamelucchi tra il 1801 e il 1805, Muhammad Ali agì con cautela per ottenere il sostegno dell'opinione pubblica.

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