Contrato de cinco anos

A 27 de agosto de 2012, os Patriots assinaram com Hernandez uma extensão de contrato de cinco anos, no valor de 39,58 milhões de dólares, que incluía 15,95 milhões de dólares garantidos e um bónus de assinatura de 12,50 milhões de dólares. O bónus de assinatura de 12,5 milhões de dólares foi o maior bónus de assinatura alguma vez recebido por um tight end da NFL. O seu total de 40 milhões de dólares foi a segunda maior extensão de contrato alguma vez dada a um tight end, depois dos 53 milhões de dólares do colega de equipa Gronkowski. Hernandez doou 50.000 dólares desse bónus a uma instituição de caridade com o nome da falecida esposa do proprietário dos Patriots. Hernandez ficou de fora durante o jogo da Semana 2 dos Patriots contra os Arizona Cardinals com uma entorse grave no tornozelo e falhou várias semanas. A 10 de dezembro, durante o jogo de Monday Night Football contra os Houston Texans, Hernandez registou oito receções para 58 jardas e dois touchdowns. A última aparição de Hernandez na NFL foi no jogo do Campeonato da AFC de 2012, a 20 de janeiro de 2013, contra os Baltimore Ravens.

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