Küba Devrimi'nin başarısından kısa bir süre sonra, yeni rejimi devirmek amacıyla militan karşı-devrimci gruplar gelişti. Hükümet güçlerine karşı silahlı saldırılar düzenlediler. 3 Nisan 1961'de Bayamo'daki milis kışlasına düzenlenen bombalı saldırıda dört milis öldü, sekiz kişi yaralandı.
4 Nisan 1961'de Başkan Kennedy, yeterince uzun bir havaalanına sahip olduğu, Trinidad planına göre büyük sivil gruplardan daha uzakta olduğu ve askeri açıdan daha az "gürültülü" olduğu için Domuzlar Körfezi planını (Operasyon Zapata olarak da bilinir) onayladı; bu da doğrudan ABD müdahalesinin reddini daha inandırıcı kılacaktı. İşgal çıkarma alanı, Las Villas Eyaleti'ndeki Bahía de Cochinos (Domuzlar Körfezi) sınırındaki plajlara değiştirildi.
Eisenhower yönetimi, Küba'daki Fidel Castro rejimini devirmek için bir plan hazırlamıştı. Merkezi İstihbarat Teşkilatı (CIA) liderliğinde ve ABD ordusunun yardımıyla hazırlanan plan, CIA paramiliter subayları tarafından yönetilen, ABD tarafından eğitilmiş, Castro karşıtı Kübalı sürgünlerden oluşan karşı-devrimci bir isyancı grubun Küba'yı işgal etmesini öngörüyordu. Amaç, Küba'yı işgal etmek ve Castro'yu iktidardan uzaklaştırmak umuduyla Küba halkı arasında bir ayaklanma başlatmaktı. Kennedy, nihai işgal planını 4 Nisan 1961'de onayladı.
9 Nisan 1961'de 2506. Tugay personeli, gemileri ve uçakları Guatemala'dan Puerto Cabezas'a transfer edilmeye başlandı. Curtiss C-46'lar ayrıca Retalhuleu ile Puerto Cabezas'taki bir CIA üssü (kod adı JMTide, diğer adıyla Happy Valley) arasında nakliye için kullanıldı.
Küba güvenlik aygıtı, kapsamlı gizli istihbarat ağı aracılığıyla işgalin geleceğini biliyordu. Yine de, işgalden günler önce, 13 Nisan'da Havana'daki bir mağazada bir dükkan çalışanının ölümüyle sonuçlanan kundaklama saldırısı olan El Encanto yangını gibi çok sayıda sabotaj eylemi gerçekleştirildi.
Karanlığın örtüsü altında, işgal filosu 14 Nisan gecesi Puerto Cabezas, Nikaragua'dan yola çıktı ve Domuzlar Körfezi'ne doğru ilerledi.
Sekiz B-26'nın Küba havaalanlarına saldırmak için Puerto Cabezas'tan havalanmasından yaklaşık 90 dakika sonra, başka bir B-26, Küba'ya yaklaşan ancak kuzeye, Florida'ya doğru yönelen bir aldatma uçuşu gerçekleştirdi. Bombardıman grupları gibi, sahte FAR işaretleri ve diğerlerinden en az ikisinde boyanmış olan 933 numarasının aynısını taşıyordu. Kalkıştan önce, uçağın iki motorundan birinin kaportası CIA personeli tarafından çıkarıldı, ateş edildi ve ardından uçağın uçuş sırasında bir noktada yerden ateş aldığına dair sahte bir görünüm vermek için yeniden takıldı. Küba'nın kuzeyinde güvenli bir mesafede, pilot kaportasında önceden yerleştirilmiş mermi delikleri olan motoru durdurdu, bir mayday çağrısı yaptı ve Miami Uluslararası havaalanına inmek için acil izin istedi. İndi ve havaalanının askeri bölgesinde bir Hava Kuvvetleri C-47'sinin yakınına taksi yaptı ve birkaç hükümet aracı tarafından karşılandı. Pilot, daha önce FAEC'te (Batista yönetimindeki Küba Hava Kuvvetleri) görev yapmış olan Mario Zúñiga'ydı ve indikten sonra 'Juan Garcia' kılığına girdi ve kamuoyuna üç meslektaşının da FAR'dan iltica ettiğini iddia etti.
15 Nisan'da CIA tarafından sağlanan B-26 uçakları üç Küba askeri havaalanını bombaladı; ABD, faillerin Küba hava kuvvetlerinden kaçan pilotlar olduğunu duyurdu, ancak Castro bu iddiaların yanlış bayrak dezenformasyonu olduğunu ifşa etti.
15 Nisan'da, Efigenio Ameijeiras liderliğindeki Küba ulusal polisi, binlerce şüpheli devrim karşıtı kişiyi tutuklama ve onları Karl Marx Tiyatrosu, Fortaleza de la Cabana'nın hendeği ve Havana'daki Principe Kalesi ve Matanzas'taki beyzbol parkı gibi geçici yerlerde gözaltına alma sürecini başlattı.
14/15 Nisan gecesi, Higinio 'Nino' Diaz komutasındaki yaklaşık 164 Kübalı sürgün tarafından Baracoa, Oriente Eyaleti yakınlarında şaşırtma amaçlı bir çıkarma planlandı. Keşif tekneleri, mürettebatın sahil şeridi boyunca Küba milis güçlerinin faaliyetlerini tespit etmesinin ardından gemiye geri döndü. Bu faaliyetlerin bir sonucu olarak, gün ağarırken Santiago de Cuba'dan Baracoa bölgesi üzerinde bir keşif sortisi başlatıldı. Bu, Teğmen Orestes Acosta tarafından pilotluğu yapılan bir FAR (Fuerza Aérea Revolucionaria) (Küba Hava Kuvvetleri) T-33 uçağıydı ve ölümcül bir şekilde denize çakıldı.
15 Nisan 1961'de, yerel saatle sabah 06:00 civarında, üç gruptaki sekiz Douglas B-26B Invader bombardıman uçağı, Havana yakınlarındaki San Antonio de los Baños ve Ciudad Libertad'daki (eski adı Campo Columbia) üç Küba havaalanına ve ayrıca Santiago de Cuba'daki Antonio Maceo Uluslararası Havaalanına eş zamanlı olarak saldırdı.
15 Nisan günü saat 10:30'da Birleşmiş Milletler'de Küba Dışişleri Bakanı Raúl Roa, ABD'yi Küba'ya karşı saldırgan hava saldırıları düzenlemekle suçladı ve o öğleden sonra BM Genel Kurulu'nun Siyasi (Birinci) Komitesi'ne resmen bir önerge sundu. Sadece günler önce CIA, Raúl Roa'yı iltica etmeye ikna etmek için başarısız bir girişimde bulunmuştu.
16 Nisan'da Merardo Leon, Jose Leon ve diğer 14 kişi, Las Villas'taki Las Delicias Çiftliği'nde silahlı bir ayaklanma başlattı ve sadece dördü hayatta kaldı. Leonel Martinez ve diğer üç kişi kırsala kaçtı.
16 Nisan'ın geç saatlerinde, CIA/2506. Tugay işgal filosu, New Orleans'ta silah ve malzeme yükledikten sonra asker ve diğer teçhizatın yüklendiği Nikaragua'daki Puerto Cabezas'tan yola çıkarak, Küba'nın yaklaşık 65 kilometre (40 mil) güneyindeki 'Rendezvous Point Zulu'da bir araya geldi.
15/16 Nisan gecesi, Nino Diaz grubu, Baracoa yakınlarında farklı bir konumda ikinci bir şaşırtma amaçlı çıkarma girişiminde başarısız oldu.
Saat 06:50 civarında, Playa Larga'nın güneyinde, Houston bir Sea Fury ve bir T-33'ten atılan birkaç bomba ve roketle hasar gördü ve yaklaşık iki saat sonra kaptan Luis Morse, gemiyi kasıtlı olarak körfezin batı tarafında karaya oturttu. Yaklaşık 270 asker tahliye edilmişti, ancak kıyıya ulaşmayı başaran yaklaşık 180 sağ kalan asker, silahlarının ve ekipmanlarının çoğunu kaybettikleri için daha sonraki çatışmalara katılamayacak durumdaydı. Houston'ın kaybı, 2506. Tugay'ın tıbbi malzemelerinin çoğunu taşıdığı için brigadistalar (tugay üyeleri) adına büyük bir darbe oldu; bu da yaralı brigadistaların yetersiz tıbbi bakımla idare etmek zorunda kalması anlamına geliyordu.
Saat 07:00 civarında, iki işgalci FAL B-26 uçağı, Isla de la Juventud'daki (Çam Adası) Nueva Gerona'da bulunan Küba Donanması Devriye Eskort gemisi El Baire'ye saldırıp batırdı. Daha sonra, Küba kara birliklerine saldırmak ve hava saldırısı altındaki C-46 paraşütçü uçakları ile CEF gemilerine dikkat dağıtıcı hava koruması sağlamak üzere iki diğer B-26 uçağına katılmak için Girón'a ilerlediler.
Saat 07:30 civarında, beş C-46 ve bir C-54 nakliye uçağı, Şahin Operasyonu kod adlı bir eylemde 2506. Tugay'ın paraşüt taburundan 177 paraşütçüyü havadan indirdi. Yaklaşık 30 adam ve ağır teçhizat, Central Australia şeker fabrikasının güneyine, Palpite ve Playa Larga yoluna bırakıldı, ancak teçhizat bataklıklarda kayboldu ve birlikler yolu kapatmayı başaramadı. Diğer birlikler San Blas'a, Covadonga ile San Blas arasındaki Jocuma'ya ve Yaguaramas ile San Blas arasındaki Horquitas'a bırakıldı. Yolları kapatmak için kullanılan bu mevziler, Playa Girón'dan gelen kara birlikleri ve tanklarla takviye edilerek iki gün boyunca korundu.
Saat 08:30 civarında, Carlos Ulloa Arauz tarafından kullanılan bir FAR Sea Fury, paraşütçüleri bıraktıktan sonra güneye dönen bir FAL C-46 ile karşılaştıktan sonra, stall olması veya uçaksavar ateşi nedeniyle körfezde düştü.
Saat 09:00 itibarıyla, bölge dışından gelen Küba birlikleri ve milisler Central Australia şeker fabrikasına, Covadonga'ya ve Yaguaramas'a varmaya başlamıştı. Gün boyunca daha fazla birlik, ağır zırhlı araçlar ve genellikle düz yataklı kamyonlarla taşınan T-34 tanklarıyla takviye edildiler.
Saat 09:30 civarında, FAR Sea Fury ve T-33 uçakları Rio Escondido'ya roket ateşledi; gemi daha sonra 'havaya uçtu' ve Girón'un yaklaşık 3 kilometre (1,9 mil) güneyinde battı. Rio Escondido havacılık yakıtı yüklüydü ve gemi yanmaya başladığında kaptan gemiyi terk etme emri verdi; gemi kısa bir süre sonra üç patlamayla yok oldu. Rio Escondido sadece yakıt değil, aynı zamanda Tugay'ın Kurtuluş Hava Kuvvetleri ile iletişim kurmasını sağlayan telsizi ve on gün yetecek kadar mühimmat, yiyecek ve tıbbi malzeme de taşıyordu. İletişim gemisi Rio Escondido'nun kaybı, San Román'ın yalnızca Mavi Plaj'daki (Blue Beach) kuvvetlere emir verebildiği, Kırmızı Plaj'da (Red Beach) veya paraşütçülerle neler olup bittiğine dair hiçbir fikrinin olmadığı anlamına geliyordu.
Kırmızı Plaj'dan gelen bir haberci saat 10:00 civarında San Román'a ulaştı ve Central Australia şeker fabrikasından gelen yolu kapatmak için tank ve piyade göndermesini istedi; San Román bu talebi kabul etti. Hükümet kuvvetlerinin bu yönden karşı saldırıya geçmesi beklenmiyordu.
Saat 11:00 civarında, geriye kalan iki yük gemisi Caribe ve Atlántico ile CIA'ye ait LCI ve LCU'lar uluslararası sulara doğru çekilmeye başladı, ancak FAR uçakları tarafından takip edilmeye devam ettiler. Öğle saatlerinde, bir FAR B-26 uçağı Blagar'dan gelen yoğun uçaksavar ateşi nedeniyle havada patladı ve pilot Luis Silva Tablada (ikinci sortisinde) ile üç kişilik mürettebatı hayatını kaybetti.
Öğleden sonra 2:30'da 339. Tabur'dan bir milis grubu, brigadista M41 Walker Bulldog tanklarının saldırısına uğrayan bir mevzi kurdu ve savunmacılara ağır kayıplar verdirdi. Bu olay, milislerin çoğu hayatını kaybettiği için Küba'da "Kayıp Tabur Katliamı" olarak anılır.
Saat 16:00 itibarıyla Fidel Castro, Central Australia şeker fabrikasına varmış ve o gün şafaktan önce muharebe alanı komutanı olarak atadığı José Ramón Fernández'e katılmıştı.
Akşam saat 8:00'de Küba Ordusu, Playa Larga'daki brigadista kuvvetlerine 76.2mm ve 122mm'lik topçu bataryalarıyla ateş açtı; bunu gece yarısı civarında T-34 tanklarının saldırısı izledi.
17 Nisan 1961 günü saat 21:00 civarında, üç FAL B-26 uçağının San Antonio de Los Baños havaalanına düzenlediği gece hava saldırısı, bildirildiğine göre beceriksizlik ve kötü hava koşulları nedeniyle başarısız oldu. Diğer iki B-26 uçağı kalkıştan sonra görevi iptal etmişti. Diğer kaynaklar, yoğun uçaksavar ateşinin mürettebatı korkuttuğunu iddia ediyor. Gece çökerken, Atlantico ve Caribe, Blagar ve Barbara J. tarafından takip edilmek üzere Küba'dan uzaklaştı.
CIA ve Demokratik Devrimci Cephe, Nikaragua'da 1.400 kişilik bir ordu olan 2506. Tugay'ı konuşlandırmıştı. 16-17 Nisan gecesi 2506. Tugay, Küba'nın Domuzlar Körfezi'ne çıkarma yaptı ve yerel bir devrimci milis gücüyle çatışmaya girdi.
17 Nisan 1961'de, ABD tarafından eğitilmiş 1.400 Kübalı sürgün, Domuzlar Körfezi Çıkarması sırasında Küba'yı işgal etti. Guevara çatışmalarda kilit bir rol oynamadı, çünkü işgalden bir gün önce Deniz Piyadelerini taşıyan bir savaş gemisi Pinar del Río'nun Batı Kıyısı'nda sahte bir çıkarma yaparak Guevara komutasındaki güçleri o bölgeye çekti.
17 Nisan 1961 günü saat 00:00 civarında, her birinde bir CIA 'operasyon subayı' ve beş kurbağa adamdan oluşan bir Sualtı İmha Ekibi (UDT) bulunan iki CIA LCI'sı Blagar ve Barbara J, Küba'nın güney kıyısındaki Domuzlar Körfezi'ne (Bahía de Cochinos) girdi. Bu gemiler, 2506. Tugay'ın yaklaşık 1.400 Kübalı sürgün kara askerini, ayrıca Tugay'ın M41 Walker Bulldog tanklarını ve çıkarma gemilerindeki diğer araçları taşıyan dört nakliye gemisine (Houston, Río Escondido, Caribe ve Atlántico) öncülük etti.
16/17 Nisan gecesi, CIA ajanları tarafından Pinar del Río Eyaleti, Bahía Honda yakınlarında sahte bir şaşırtma çıkarması düzenlendi. Gemi kaynaklı bir istila çıkarmasının seslerini ve diğer etkilerini yayınlayan ekipmanları taşıyan bir filo, Fidel Castro'yu kısa süreliğine Domuzlar Körfezi savaş cephesinden uzaklaştıran Küba raporlarının kaynağını oluşturdu.
Domuzlar Körfezi Çıkarması 17 Nisan 1961'de başladı.
17 Nisan 1961'de, Osvaldo Ramírez (Castro'ya karşı kırsal direnişin lideri), Aromas de Velázquez'de Castro'nun güçleri tarafından yakalandı ve derhal idam edildi.
Saat 01:00 civarında, savaş alanı komuta gemisi olan Blagar, kurbağa adamların lastik botlarla önderlik ettiği, ardından Caribe'den gelen askerlerin küçük alüminyum botlarla, daha sonra ise M41 Walker Bulldog tanklarını taşıyan LCVP ve LCU'ların takip ettiği Playa Girón'daki (kod adı Mavi Plaj) ana çıkarmayı yönetti. Houston'a öncülük eden Barbara J, benzer şekilde küçük fiberglas botlar kullanarak 35 km daha kuzeybatıdaki Playa Larga'da (kod adı Kırmızı Plaj) askerleri karaya çıkardı. Askerlerin gece tahliyesi, motor arızaları ve öngörülemeyen mercan kayalıkları nedeniyle hasar gören tekneler yüzünden gecikti; CIA başlangıçta mercan kayalığının deniz yosunu olduğunu düşünmüştü. Kurbağa adamlar karaya çıktıklarında, Kırmızı Plaj'ın projektörlerle aydınlatıldığını görünce şok oldular, bu da çıkarma yerinin aceleyle değiştirilmesine yol açtı. Kurbağa adamlar karaya çıktıklarında, Kübalı milisleri taşıyan bir cipin oradan geçmesiyle bir çatışma patlak verdi. Bölgedeki az sayıdaki milis, işgalciler sembolik direnişlerini aşmadan kısa bir süre sonra, ilk çıkarmadan hemen sonra telsiz yoluyla Küba silahlı kuvvetlerini uyarmayı başardı.
Sabah 5:00 itibarıyla Oliva, neredeyse hiç mühimmatı veya havan topu mermisi kalmadığı için adamlarına geri çekilme emri vermeye başladı.
Şafak vakti, sabah 06:30 civarında, üç FAR Sea Fury, bir B-26 bombardıman uçağı ve iki Lockheed T-33 savaş jeti, hala asker boşaltmakta olan CEF gemilerine saldırmaya başladı.
2506. Tugay'ın M41 Walker Bulldog tanklarının tamamı sabah 7:30'da Mavi Plaj'a, askerlerin tamamı ise 8:30'da karaya çıkmıştı. Ne Mavi Plaj'daki San Román ne de Kırmızı Plaj'daki Erneido Oliva, telsizlerin tamamı çıkarma sırasında suya düşüp ıslandığı için iletişim kurabiliyordu.
Saat 11:00 civarında, Küba hükümeti San Blas'ı almak için bir saldırı başlattı. San Román, San Blas'ı tutmak için tüm paraşütçülere geri dönmeleri emrini verdi ve saldırıyı durdurdular. Öğleden sonra Castro, brigadistaları sürekli hava saldırısı ve topçu ateşi altında tuttu ancak yeni bir büyük saldırı emri vermedi.
Saat 14:00'te Başkan Kennedy, Moskova'daki Nikita Kruşçev'den Rusların ABD'nin Küba'ya girmesine izin vermeyeceğini belirten ve uyarılarının dikkate alınmaması durumunda Amerika Birleşik Devletleri'nin kalbine hızlı bir nükleer misilleme yapılacağını ima eden bir telgraf aldı.
17-18 Nisan gecesi, Kırmızı Plaj'daki kuvvetler Küba Ordusu ve milislerinin tekrarlanan karşı saldırılarına maruz kaldı. Kayıplar arttıkça ve mühimmat tükendikçe, brigadistalar yavaş yavaş geri çekildi. Dört C-54 ve 2 C-46'dan yapılan hava indirmeleri, daha fazla mühimmat indirme konusunda sadece sınırlı bir başarı sağladı.
Kırmızı Plaj'dan gelen adamlar Girón'a vardıklarında, San Román ve Oliva durumu görüşmek üzere bir araya geldi. Mühimmatın azalmasıyla birlikte Oliva, 2506. Tugay'ın gerilla savaşı yürütmek için Escambray dağlarına çekilmesini önerdi, ancak San Román plaj başını tutmaya karar verdi.
Saat 01:00'de Küba Ordusu piyadeleri ve milisleri bir saldırı başlattı. Komünist güçlerin ağır kayıplarına rağmen, mühimmat kıtlığı brigadistaları geri çekilmeye zorladı ve T-34 tankları saldırıyı sürdürmek için savaş alanının enkazı arasından yollarına devam etti.
Sabah 10'da bir tank savaşı patlak verdi ve brigadistalar hatlarını saat 14:00'e kadar korudular, bu da Oliva'nın Girón'a geri çekilme emri vermesine yol açtı.
18 Nisan saat 17:00 civarında, FAL B-26'ları, Playa Larga ile Punta Perdiz arasında güneydoğuya doğru ilerleyen, tank ve diğer zırhlı araçları taşıyan kamyonların öncülük ettiği 12 özel otobüsten oluşan bir Küba konvoyuna saldırdı. Siviller, milisler, polisler ve askerlerle dolu araçlar bombalar, napalm ve roketlerle saldırıya uğradı ve ağır kayıplar verdi.
18 Nisan gecesi, bir FAL C-46, 2506. Tugay kara kuvvetlerinin işgal ettiği Girón hava pistine silah ve teçhizat indirdi ve 19 Nisan şafak vaktinden önce havalandı.
18 Nisan saat 10:30 civarında, T-34 tankları ve 122 mm'lik toplarla desteklenen Küba askerleri ve milisleri, Tugay kuvvetlerinin sabahın erken saatlerinde Girón'a doğru kaçmasının ardından Playa Larga'yı ele geçirdi. Gün boyunca Tugay kuvvetleri, Covadonga ve Yaguaramas'tan gelen iki yol boyunca San Blas'a çekildi. O zamana kadar hem Fidel Castro hem de José Ramón Fernández o cephe bölgesine yeniden konuşlanmıştı.
Son hava saldırılarının ardından San Román, paraşütçülerine ve 3. Tabur adamlarına bir sürpriz saldırı başlatmaları emrini verdi; bu saldırı başlangıçta başarılı oldu ancak kısa süre sonra başarısızlığa uğradı. Brigadistaların düzensiz geri çekilmesiyle birlikte, Küba Ordusu ve milisleri hızla ilerlemeye başladı, San Blas'ı ele geçirdiler ancak saat 11 civarında Girón'un dışında durduruldular.
Son hava saldırısı görevi (kod adı Mad Dog Flight), dördü Amerikalı CIA sözleşmeli uçuş ekipleri ve Alabama Hava Muhafızları'ndan gönüllü pilotlar tarafından kullanılan beş B-26'dan oluşuyordu. Bir FAR Sea Fury (Douglas Rudd tarafından pilotluk edildi) ve iki FAR T-33 (Rafael del Pino ve Alvaro Prendes tarafından pilotluk edildi), bu B-26'lardan ikisini düşürerek dört Amerikalı havacının ölümüne neden oldu. Muharebe hava devriyeleri, USS Essex'ten kalkan ve milliyet ile diğer işaretleri kaldırılmış VA-34 filosuna ait Douglas A4D-2N Skyhawk jetleri tarafından gerçekleştirildi. Sortiler, Tugay askerlerine ve pilotlarına güven vermek ve doğrudan savaş eylemlerine girmeden Küba hükümet güçlerini korkutmak amacıyla uçuruldu.
19 Nisan 1961'e gelindiğinde, Küba hükümeti işgalci sürgünleri yakalamış veya öldürmüştü ve Kennedy, 1.189 hayatta kalan kişinin serbest bırakılması için müzakere etmek zorunda kaldı. Yirmi ay sonra Küba, yakalanan sürgünleri 53 milyon dolar değerinde gıda ve ilaç karşılığında serbest bıraktı.
19 Nisan'ın geç saatlerinde, muhripler USS Eaton (kod adı Santiago) ve USS Murray (kod adı Tampico), Küba ordusu tanklarından gelen ateşin Komodor Crutchfield'a geri çekilme emri vermesine neden olmasından önce, geri çekilen Tugay askerlerini plajlardan tahliye etmek için Cochinos Körfezi'ne girdi.
19 Nisan 1961'de, iki günlük bir duruşmanın ardından Pinar del Rio eyaletinde en az yedi Kübalı ve CIA tarafından kiralanan iki ABD vatandaşı (Angus K. McNair ve Howard F. Anderson) idam edildi.
20 Nisan'da, 18 Mart'ta 14 ton patlayıcıyla Küba'ya sızdıktan sonra tutuklanan Humberto Sorí Marin, Fortaleza de la Cabaña'da idam edildi. Komplocu arkadaşları Rogelio González Corzo (takma adı "Francisco Gutierrez"), Rafael Diaz Hanscom, Eufemio Fernandez, Arturo Hernandez Tellaheche ve Manuel Lorenzo Puig Miyar da idam edildi.
Castro, karşı saldırıyı başlatması için Yüzbaşı José Ramón Fernández'e emir verdi ve ardından kontrolü bizzat ele aldı. İstilacıların gemilerini bombalayıp takviye kuvvet getirdikten sonra Castro, 20 Nisan'da Tugay'ı teslim olmaya zorladı.
21 Nisan'da Eaton ve Murray, 22 Nisan'da muhripler USS Conway ve USS Cony, ayrıca denizaltı USS Threadfin ve bir CIA PBY-5A Catalina uçan teknesinin katılımıyla, kıyı şeridini, resifleri ve adaları dağılmış Tugay hayatta kalanları için aramaya devam etti ve yaklaşık 24-30 kişi kurtarıldı.
Daha çok Yaeko Ueno olarak anılan Yaeko Sakano, 1925'teki ölümüne kadar yaklaşık 10 yıl boyunca Hidesaburō Ueno'nun evli olmadığı partneriydi. Hachikō'nun, onu ziyarete geldiği her seferinde ona karşı büyük bir mutluluk ve sevgi gösterdiği bildirilmiştir. Yaeko, 30 Nisan 1961'de 76 yaşında öldü ve aile üyelerinden merhum partneriyle birlikte gömülme taleplerine rağmen, Ueno'nun mezarından daha uzakta, Taitō'daki bir tapınağa gömüldü.
Küba Devrimi'nin başarısından kısa bir süre sonra, yeni rejimi devirmek amacıyla militan karşı-devrimci gruplar gelişti. Hükümet güçlerine karşı silahlı saldırılar düzenlediler. 3 Nisan 1961'de Bayamo'daki milis kışlasına düzenlenen bombalı saldırıda dört milis öldü, sekiz kişi yaralandı.
4 Nisan 1961'de Başkan Kennedy, yeterince uzun bir havaalanına sahip olduğu, Trinidad planına göre büyük sivil gruplardan daha uzakta olduğu ve askeri açıdan daha az "gürültülü" olduğu için Domuzlar Körfezi planını (Operasyon Zapata olarak da bilinir) onayladı; bu da doğrudan ABD müdahalesinin reddini daha inandırıcı kılacaktı. İşgal çıkarma alanı, Las Villas Eyaleti'ndeki Bahía de Cochinos (Domuzlar Körfezi) sınırındaki plajlara değiştirildi.
Eisenhower yönetimi, Küba'daki Fidel Castro rejimini devirmek için bir plan hazırlamıştı. Merkezi İstihbarat Teşkilatı (CIA) liderliğinde ve ABD ordusunun yardımıyla hazırlanan plan, CIA paramiliter subayları tarafından yönetilen, ABD tarafından eğitilmiş, Castro karşıtı Kübalı sürgünlerden oluşan karşı-devrimci bir isyancı grubun Küba'yı işgal etmesini öngörüyordu. Amaç, Küba'yı işgal etmek ve Castro'yu iktidardan uzaklaştırmak umuduyla Küba halkı arasında bir ayaklanma başlatmaktı. Kennedy, nihai işgal planını 4 Nisan 1961'de onayladı.
9 Nisan 1961'de 2506. Tugay personeli, gemileri ve uçakları Guatemala'dan Puerto Cabezas'a transfer edilmeye başlandı. Curtiss C-46'lar ayrıca Retalhuleu ile Puerto Cabezas'taki bir CIA üssü (kod adı JMTide, diğer adıyla Happy Valley) arasında nakliye için kullanıldı.
Küba güvenlik aygıtı, kapsamlı gizli istihbarat ağı aracılığıyla işgalin geleceğini biliyordu. Yine de, işgalden günler önce, 13 Nisan'da Havana'daki bir mağazada bir dükkan çalışanının ölümüyle sonuçlanan kundaklama saldırısı olan El Encanto yangını gibi çok sayıda sabotaj eylemi gerçekleştirildi.
Karanlığın örtüsü altında, işgal filosu 14 Nisan gecesi Puerto Cabezas, Nikaragua'dan yola çıktı ve Domuzlar Körfezi'ne doğru ilerledi.
Sekiz B-26'nın Küba havaalanlarına saldırmak için Puerto Cabezas'tan havalanmasından yaklaşık 90 dakika sonra, başka bir B-26, Küba'ya yaklaşan ancak kuzeye, Florida'ya doğru yönelen bir aldatma uçuşu gerçekleştirdi. Bombardıman grupları gibi, sahte FAR işaretleri ve diğerlerinden en az ikisinde boyanmış olan 933 numarasının aynısını taşıyordu. Kalkıştan önce, uçağın iki motorundan birinin kaportası CIA personeli tarafından çıkarıldı, ateş edildi ve ardından uçağın uçuş sırasında bir noktada yerden ateş aldığına dair sahte bir görünüm vermek için yeniden takıldı. Küba'nın kuzeyinde güvenli bir mesafede, pilot kaportasında önceden yerleştirilmiş mermi delikleri olan motoru durdurdu, bir mayday çağrısı yaptı ve Miami Uluslararası havaalanına inmek için acil izin istedi. İndi ve havaalanının askeri bölgesinde bir Hava Kuvvetleri C-47'sinin yakınına taksi yaptı ve birkaç hükümet aracı tarafından karşılandı. Pilot, daha önce FAEC'te (Batista yönetimindeki Küba Hava Kuvvetleri) görev yapmış olan Mario Zúñiga'ydı ve indikten sonra 'Juan Garcia' kılığına girdi ve kamuoyuna üç meslektaşının da FAR'dan iltica ettiğini iddia etti.
15 Nisan'da CIA tarafından sağlanan B-26 uçakları üç Küba askeri havaalanını bombaladı; ABD, faillerin Küba hava kuvvetlerinden kaçan pilotlar olduğunu duyurdu, ancak Castro bu iddiaların yanlış bayrak dezenformasyonu olduğunu ifşa etti.
15 Nisan'da, Efigenio Ameijeiras liderliğindeki Küba ulusal polisi, binlerce şüpheli devrim karşıtı kişiyi tutuklama ve onları Karl Marx Tiyatrosu, Fortaleza de la Cabana'nın hendeği ve Havana'daki Principe Kalesi ve Matanzas'taki beyzbol parkı gibi geçici yerlerde gözaltına alma sürecini başlattı.
14/15 Nisan gecesi, Higinio 'Nino' Diaz komutasındaki yaklaşık 164 Kübalı sürgün tarafından Baracoa, Oriente Eyaleti yakınlarında şaşırtma amaçlı bir çıkarma planlandı. Keşif tekneleri, mürettebatın sahil şeridi boyunca Küba milis güçlerinin faaliyetlerini tespit etmesinin ardından gemiye geri döndü. Bu faaliyetlerin bir sonucu olarak, gün ağarırken Santiago de Cuba'dan Baracoa bölgesi üzerinde bir keşif sortisi başlatıldı. Bu, Teğmen Orestes Acosta tarafından pilotluğu yapılan bir FAR (Fuerza Aérea Revolucionaria) (Küba Hava Kuvvetleri) T-33 uçağıydı ve ölümcül bir şekilde denize çakıldı.
15 Nisan 1961'de, yerel saatle sabah 06:00 civarında, üç gruptaki sekiz Douglas B-26B Invader bombardıman uçağı, Havana yakınlarındaki San Antonio de los Baños ve Ciudad Libertad'daki (eski adı Campo Columbia) üç Küba havaalanına ve ayrıca Santiago de Cuba'daki Antonio Maceo Uluslararası Havaalanına eş zamanlı olarak saldırdı.
15 Nisan günü saat 10:30'da Birleşmiş Milletler'de Küba Dışişleri Bakanı Raúl Roa, ABD'yi Küba'ya karşı saldırgan hava saldırıları düzenlemekle suçladı ve o öğleden sonra BM Genel Kurulu'nun Siyasi (Birinci) Komitesi'ne resmen bir önerge sundu. Sadece günler önce CIA, Raúl Roa'yı iltica etmeye ikna etmek için başarısız bir girişimde bulunmuştu.
16 Nisan'da Merardo Leon, Jose Leon ve diğer 14 kişi, Las Villas'taki Las Delicias Çiftliği'nde silahlı bir ayaklanma başlattı ve sadece dördü hayatta kaldı. Leonel Martinez ve diğer üç kişi kırsala kaçtı.
16 Nisan'ın geç saatlerinde, CIA/2506. Tugay işgal filosu, New Orleans'ta silah ve malzeme yükledikten sonra asker ve diğer teçhizatın yüklendiği Nikaragua'daki Puerto Cabezas'tan yola çıkarak, Küba'nın yaklaşık 65 kilometre (40 mil) güneyindeki 'Rendezvous Point Zulu'da bir araya geldi.
15/16 Nisan gecesi, Nino Diaz grubu, Baracoa yakınlarında farklı bir konumda ikinci bir şaşırtma amaçlı çıkarma girişiminde başarısız oldu.
Saat 06:50 civarında, Playa Larga'nın güneyinde, Houston bir Sea Fury ve bir T-33'ten atılan birkaç bomba ve roketle hasar gördü ve yaklaşık iki saat sonra kaptan Luis Morse, gemiyi kasıtlı olarak körfezin batı tarafında karaya oturttu. Yaklaşık 270 asker tahliye edilmişti, ancak kıyıya ulaşmayı başaran yaklaşık 180 sağ kalan asker, silahlarının ve ekipmanlarının çoğunu kaybettikleri için daha sonraki çatışmalara katılamayacak durumdaydı. Houston'ın kaybı, 2506. Tugay'ın tıbbi malzemelerinin çoğunu taşıdığı için brigadistalar (tugay üyeleri) adına büyük bir darbe oldu; bu da yaralı brigadistaların yetersiz tıbbi bakımla idare etmek zorunda kalması anlamına geliyordu.
Saat 07:00 civarında, iki işgalci FAL B-26 uçağı, Isla de la Juventud'daki (Çam Adası) Nueva Gerona'da bulunan Küba Donanması Devriye Eskort gemisi El Baire'ye saldırıp batırdı. Daha sonra, Küba kara birliklerine saldırmak ve hava saldırısı altındaki C-46 paraşütçü uçakları ile CEF gemilerine dikkat dağıtıcı hava koruması sağlamak üzere iki diğer B-26 uçağına katılmak için Girón'a ilerlediler.
Saat 07:30 civarında, beş C-46 ve bir C-54 nakliye uçağı, Şahin Operasyonu kod adlı bir eylemde 2506. Tugay'ın paraşüt taburundan 177 paraşütçüyü havadan indirdi. Yaklaşık 30 adam ve ağır teçhizat, Central Australia şeker fabrikasının güneyine, Palpite ve Playa Larga yoluna bırakıldı, ancak teçhizat bataklıklarda kayboldu ve birlikler yolu kapatmayı başaramadı. Diğer birlikler San Blas'a, Covadonga ile San Blas arasındaki Jocuma'ya ve Yaguaramas ile San Blas arasındaki Horquitas'a bırakıldı. Yolları kapatmak için kullanılan bu mevziler, Playa Girón'dan gelen kara birlikleri ve tanklarla takviye edilerek iki gün boyunca korundu.
Saat 08:30 civarında, Carlos Ulloa Arauz tarafından kullanılan bir FAR Sea Fury, paraşütçüleri bıraktıktan sonra güneye dönen bir FAL C-46 ile karşılaştıktan sonra, stall olması veya uçaksavar ateşi nedeniyle körfezde düştü.
Saat 09:00 itibarıyla, bölge dışından gelen Küba birlikleri ve milisler Central Australia şeker fabrikasına, Covadonga'ya ve Yaguaramas'a varmaya başlamıştı. Gün boyunca daha fazla birlik, ağır zırhlı araçlar ve genellikle düz yataklı kamyonlarla taşınan T-34 tanklarıyla takviye edildiler.
Saat 09:30 civarında, FAR Sea Fury ve T-33 uçakları Rio Escondido'ya roket ateşledi; gemi daha sonra 'havaya uçtu' ve Girón'un yaklaşık 3 kilometre (1,9 mil) güneyinde battı. Rio Escondido havacılık yakıtı yüklüydü ve gemi yanmaya başladığında kaptan gemiyi terk etme emri verdi; gemi kısa bir süre sonra üç patlamayla yok oldu. Rio Escondido sadece yakıt değil, aynı zamanda Tugay'ın Kurtuluş Hava Kuvvetleri ile iletişim kurmasını sağlayan telsizi ve on gün yetecek kadar mühimmat, yiyecek ve tıbbi malzeme de taşıyordu. İletişim gemisi Rio Escondido'nun kaybı, San Román'ın yalnızca Mavi Plaj'daki (Blue Beach) kuvvetlere emir verebildiği, Kırmızı Plaj'da (Red Beach) veya paraşütçülerle neler olup bittiğine dair hiçbir fikrinin olmadığı anlamına geliyordu.
Kırmızı Plaj'dan gelen bir haberci saat 10:00 civarında San Román'a ulaştı ve Central Australia şeker fabrikasından gelen yolu kapatmak için tank ve piyade göndermesini istedi; San Román bu talebi kabul etti. Hükümet kuvvetlerinin bu yönden karşı saldırıya geçmesi beklenmiyordu.
Saat 11:00 civarında, geriye kalan iki yük gemisi Caribe ve Atlántico ile CIA'ye ait LCI ve LCU'lar uluslararası sulara doğru çekilmeye başladı, ancak FAR uçakları tarafından takip edilmeye devam ettiler. Öğle saatlerinde, bir FAR B-26 uçağı Blagar'dan gelen yoğun uçaksavar ateşi nedeniyle havada patladı ve pilot Luis Silva Tablada (ikinci sortisinde) ile üç kişilik mürettebatı hayatını kaybetti.
Öğleden sonra 2:30'da 339. Tabur'dan bir milis grubu, brigadista M41 Walker Bulldog tanklarının saldırısına uğrayan bir mevzi kurdu ve savunmacılara ağır kayıplar verdirdi. Bu olay, milislerin çoğu hayatını kaybettiği için Küba'da "Kayıp Tabur Katliamı" olarak anılır.
Saat 16:00 itibarıyla Fidel Castro, Central Australia şeker fabrikasına varmış ve o gün şafaktan önce muharebe alanı komutanı olarak atadığı José Ramón Fernández'e katılmıştı.
Akşam saat 8:00'de Küba Ordusu, Playa Larga'daki brigadista kuvvetlerine 76.2mm ve 122mm'lik topçu bataryalarıyla ateş açtı; bunu gece yarısı civarında T-34 tanklarının saldırısı izledi.
17 Nisan 1961 günü saat 21:00 civarında, üç FAL B-26 uçağının San Antonio de Los Baños havaalanına düzenlediği gece hava saldırısı, bildirildiğine göre beceriksizlik ve kötü hava koşulları nedeniyle başarısız oldu. Diğer iki B-26 uçağı kalkıştan sonra görevi iptal etmişti. Diğer kaynaklar, yoğun uçaksavar ateşinin mürettebatı korkuttuğunu iddia ediyor. Gece çökerken, Atlantico ve Caribe, Blagar ve Barbara J. tarafından takip edilmek üzere Küba'dan uzaklaştı.
CIA ve Demokratik Devrimci Cephe, Nikaragua'da 1.400 kişilik bir ordu olan 2506. Tugay'ı konuşlandırmıştı. 16-17 Nisan gecesi 2506. Tugay, Küba'nın Domuzlar Körfezi'ne çıkarma yaptı ve yerel bir devrimci milis gücüyle çatışmaya girdi.
17 Nisan 1961'de, ABD tarafından eğitilmiş 1.400 Kübalı sürgün, Domuzlar Körfezi Çıkarması sırasında Küba'yı işgal etti. Guevara çatışmalarda kilit bir rol oynamadı, çünkü işgalden bir gün önce Deniz Piyadelerini taşıyan bir savaş gemisi Pinar del Río'nun Batı Kıyısı'nda sahte bir çıkarma yaparak Guevara komutasındaki güçleri o bölgeye çekti.
17 Nisan 1961 günü saat 00:00 civarında, her birinde bir CIA 'operasyon subayı' ve beş kurbağa adamdan oluşan bir Sualtı İmha Ekibi (UDT) bulunan iki CIA LCI'sı Blagar ve Barbara J, Küba'nın güney kıyısındaki Domuzlar Körfezi'ne (Bahía de Cochinos) girdi. Bu gemiler, 2506. Tugay'ın yaklaşık 1.400 Kübalı sürgün kara askerini, ayrıca Tugay'ın M41 Walker Bulldog tanklarını ve çıkarma gemilerindeki diğer araçları taşıyan dört nakliye gemisine (Houston, Río Escondido, Caribe ve Atlántico) öncülük etti.
16/17 Nisan gecesi, CIA ajanları tarafından Pinar del Río Eyaleti, Bahía Honda yakınlarında sahte bir şaşırtma çıkarması düzenlendi. Gemi kaynaklı bir istila çıkarmasının seslerini ve diğer etkilerini yayınlayan ekipmanları taşıyan bir filo, Fidel Castro'yu kısa süreliğine Domuzlar Körfezi savaş cephesinden uzaklaştıran Küba raporlarının kaynağını oluşturdu.
Domuzlar Körfezi Çıkarması 17 Nisan 1961'de başladı.
17 Nisan 1961'de, Osvaldo Ramírez (Castro'ya karşı kırsal direnişin lideri), Aromas de Velázquez'de Castro'nun güçleri tarafından yakalandı ve derhal idam edildi.
Saat 01:00 civarında, savaş alanı komuta gemisi olan Blagar, kurbağa adamların lastik botlarla önderlik ettiği, ardından Caribe'den gelen askerlerin küçük alüminyum botlarla, daha sonra ise M41 Walker Bulldog tanklarını taşıyan LCVP ve LCU'ların takip ettiği Playa Girón'daki (kod adı Mavi Plaj) ana çıkarmayı yönetti. Houston'a öncülük eden Barbara J, benzer şekilde küçük fiberglas botlar kullanarak 35 km daha kuzeybatıdaki Playa Larga'da (kod adı Kırmızı Plaj) askerleri karaya çıkardı. Askerlerin gece tahliyesi, motor arızaları ve öngörülemeyen mercan kayalıkları nedeniyle hasar gören tekneler yüzünden gecikti; CIA başlangıçta mercan kayalığının deniz yosunu olduğunu düşünmüştü. Kurbağa adamlar karaya çıktıklarında, Kırmızı Plaj'ın projektörlerle aydınlatıldığını görünce şok oldular, bu da çıkarma yerinin aceleyle değiştirilmesine yol açtı. Kurbağa adamlar karaya çıktıklarında, Kübalı milisleri taşıyan bir cipin oradan geçmesiyle bir çatışma patlak verdi. Bölgedeki az sayıdaki milis, işgalciler sembolik direnişlerini aşmadan kısa bir süre sonra, ilk çıkarmadan hemen sonra telsiz yoluyla Küba silahlı kuvvetlerini uyarmayı başardı.
Sabah 5:00 itibarıyla Oliva, neredeyse hiç mühimmatı veya havan topu mermisi kalmadığı için adamlarına geri çekilme emri vermeye başladı.
Şafak vakti, sabah 06:30 civarında, üç FAR Sea Fury, bir B-26 bombardıman uçağı ve iki Lockheed T-33 savaş jeti, hala asker boşaltmakta olan CEF gemilerine saldırmaya başladı.
2506. Tugay'ın M41 Walker Bulldog tanklarının tamamı sabah 7:30'da Mavi Plaj'a, askerlerin tamamı ise 8:30'da karaya çıkmıştı. Ne Mavi Plaj'daki San Román ne de Kırmızı Plaj'daki Erneido Oliva, telsizlerin tamamı çıkarma sırasında suya düşüp ıslandığı için iletişim kurabiliyordu.
Saat 11:00 civarında, Küba hükümeti San Blas'ı almak için bir saldırı başlattı. San Román, San Blas'ı tutmak için tüm paraşütçülere geri dönmeleri emrini verdi ve saldırıyı durdurdular. Öğleden sonra Castro, brigadistaları sürekli hava saldırısı ve topçu ateşi altında tuttu ancak yeni bir büyük saldırı emri vermedi.
Saat 14:00'te Başkan Kennedy, Moskova'daki Nikita Kruşçev'den Rusların ABD'nin Küba'ya girmesine izin vermeyeceğini belirten ve uyarılarının dikkate alınmaması durumunda Amerika Birleşik Devletleri'nin kalbine hızlı bir nükleer misilleme yapılacağını ima eden bir telgraf aldı.
17-18 Nisan gecesi, Kırmızı Plaj'daki kuvvetler Küba Ordusu ve milislerinin tekrarlanan karşı saldırılarına maruz kaldı. Kayıplar arttıkça ve mühimmat tükendikçe, brigadistalar yavaş yavaş geri çekildi. Dört C-54 ve 2 C-46'dan yapılan hava indirmeleri, daha fazla mühimmat indirme konusunda sadece sınırlı bir başarı sağladı.
Kırmızı Plaj'dan gelen adamlar Girón'a vardıklarında, San Román ve Oliva durumu görüşmek üzere bir araya geldi. Mühimmatın azalmasıyla birlikte Oliva, 2506. Tugay'ın gerilla savaşı yürütmek için Escambray dağlarına çekilmesini önerdi, ancak San Román plaj başını tutmaya karar verdi.
Saat 01:00'de Küba Ordusu piyadeleri ve milisleri bir saldırı başlattı. Komünist güçlerin ağır kayıplarına rağmen, mühimmat kıtlığı brigadistaları geri çekilmeye zorladı ve T-34 tankları saldırıyı sürdürmek için savaş alanının enkazı arasından yollarına devam etti.
Sabah 10'da bir tank savaşı patlak verdi ve brigadistalar hatlarını saat 14:00'e kadar korudular, bu da Oliva'nın Girón'a geri çekilme emri vermesine yol açtı.
18 Nisan saat 17:00 civarında, FAL B-26'ları, Playa Larga ile Punta Perdiz arasında güneydoğuya doğru ilerleyen, tank ve diğer zırhlı araçları taşıyan kamyonların öncülük ettiği 12 özel otobüsten oluşan bir Küba konvoyuna saldırdı. Siviller, milisler, polisler ve askerlerle dolu araçlar bombalar, napalm ve roketlerle saldırıya uğradı ve ağır kayıplar verdi.
18 Nisan gecesi, bir FAL C-46, 2506. Tugay kara kuvvetlerinin işgal ettiği Girón hava pistine silah ve teçhizat indirdi ve 19 Nisan şafak vaktinden önce havalandı.
18 Nisan saat 10:30 civarında, T-34 tankları ve 122 mm'lik toplarla desteklenen Küba askerleri ve milisleri, Tugay kuvvetlerinin sabahın erken saatlerinde Girón'a doğru kaçmasının ardından Playa Larga'yı ele geçirdi. Gün boyunca Tugay kuvvetleri, Covadonga ve Yaguaramas'tan gelen iki yol boyunca San Blas'a çekildi. O zamana kadar hem Fidel Castro hem de José Ramón Fernández o cephe bölgesine yeniden konuşlanmıştı.
Son hava saldırılarının ardından San Román, paraşütçülerine ve 3. Tabur adamlarına bir sürpriz saldırı başlatmaları emrini verdi; bu saldırı başlangıçta başarılı oldu ancak kısa süre sonra başarısızlığa uğradı. Brigadistaların düzensiz geri çekilmesiyle birlikte, Küba Ordusu ve milisleri hızla ilerlemeye başladı, San Blas'ı ele geçirdiler ancak saat 11 civarında Girón'un dışında durduruldular.
Son hava saldırısı görevi (kod adı Mad Dog Flight), dördü Amerikalı CIA sözleşmeli uçuş ekipleri ve Alabama Hava Muhafızları'ndan gönüllü pilotlar tarafından kullanılan beş B-26'dan oluşuyordu. Bir FAR Sea Fury (Douglas Rudd tarafından pilotluk edildi) ve iki FAR T-33 (Rafael del Pino ve Alvaro Prendes tarafından pilotluk edildi), bu B-26'lardan ikisini düşürerek dört Amerikalı havacının ölümüne neden oldu. Muharebe hava devriyeleri, USS Essex'ten kalkan ve milliyet ile diğer işaretleri kaldırılmış VA-34 filosuna ait Douglas A4D-2N Skyhawk jetleri tarafından gerçekleştirildi. Sortiler, Tugay askerlerine ve pilotlarına güven vermek ve doğrudan savaş eylemlerine girmeden Küba hükümet güçlerini korkutmak amacıyla uçuruldu.
19 Nisan 1961'e gelindiğinde, Küba hükümeti işgalci sürgünleri yakalamış veya öldürmüştü ve Kennedy, 1.189 hayatta kalan kişinin serbest bırakılması için müzakere etmek zorunda kaldı. Yirmi ay sonra Küba, yakalanan sürgünleri 53 milyon dolar değerinde gıda ve ilaç karşılığında serbest bıraktı.
19 Nisan'ın geç saatlerinde, muhripler USS Eaton (kod adı Santiago) ve USS Murray (kod adı Tampico), Küba ordusu tanklarından gelen ateşin Komodor Crutchfield'a geri çekilme emri vermesine neden olmasından önce, geri çekilen Tugay askerlerini plajlardan tahliye etmek için Cochinos Körfezi'ne girdi.
19 Nisan 1961'de, iki günlük bir duruşmanın ardından Pinar del Rio eyaletinde en az yedi Kübalı ve CIA tarafından kiralanan iki ABD vatandaşı (Angus K. McNair ve Howard F. Anderson) idam edildi.
20 Nisan'da, 18 Mart'ta 14 ton patlayıcıyla Küba'ya sızdıktan sonra tutuklanan Humberto Sorí Marin, Fortaleza de la Cabaña'da idam edildi. Komplocu arkadaşları Rogelio González Corzo (takma adı "Francisco Gutierrez"), Rafael Diaz Hanscom, Eufemio Fernandez, Arturo Hernandez Tellaheche ve Manuel Lorenzo Puig Miyar da idam edildi.
Castro, karşı saldırıyı başlatması için Yüzbaşı José Ramón Fernández'e emir verdi ve ardından kontrolü bizzat ele aldı. İstilacıların gemilerini bombalayıp takviye kuvvet getirdikten sonra Castro, 20 Nisan'da Tugay'ı teslim olmaya zorladı.
21 Nisan'da Eaton ve Murray, 22 Nisan'da muhripler USS Conway ve USS Cony, ayrıca denizaltı USS Threadfin ve bir CIA PBY-5A Catalina uçan teknesinin katılımıyla, kıyı şeridini, resifleri ve adaları dağılmış Tugay hayatta kalanları için aramaya devam etti ve yaklaşık 24-30 kişi kurtarıldı.
Daha çok Yaeko Ueno olarak anılan Yaeko Sakano, 1925'teki ölümüne kadar yaklaşık 10 yıl boyunca Hidesaburō Ueno'nun evli olmadığı partneriydi. Hachikō'nun, onu ziyarete geldiği her seferinde ona karşı büyük bir mutluluk ve sevgi gösterdiği bildirilmiştir. Yaeko, 30 Nisan 1961'de 76 yaşında öldü ve aile üyelerinden merhum partneriyle birlikte gömülme taleplerine rağmen, Ueno'nun mezarından daha uzakta, Taitō'daki bir tapınağa gömüldü.
