Năm 1572, thành trì cuối cùng của người Inca bị chinh phục và vị vua cuối cùng, Túpac Amaru, con trai của Manco, đã bị bắt và hành quyết. Điều này đã chấm dứt sự kháng cự đối với cuộc chinh phạt của người Tây Ban Nha dưới quyền lực chính trị của nhà nước Inca.