قرب نهاية عهد مينغ ، ساعد السور العظيم في الدفاع عن الإمبراطورية ضد غزوات المانشو التي بدأت حوالي عام 1600. وحتى بعد خسارة لياودونغ بالكامل ، احتفظ جيش مينغ بممر شانغهاي المحصن بشدة ، مما منع المانشو من غزو قلب الصين. . تمكن المانشو أخيرًا من عبور السور العظيم في عام 1644 ، بعد أن سقطت بكين بالفعل في أيدي متمردي لي تسيشنغ.
في ظل حكم تشينغ ، امتدت حدود الصين إلى ما وراء الأسوار وضمت منغوليا إلى الإمبراطورية ، لذلك توقف البناء على السور العظيم. من ناحية أخرى ، تم بناء ما يسمى بـ وليوو باليسيد، باتباع خط مشابه لجدار مينغ لياودونغ ، بواسطة حكام تشينغ في منشوريا. ومع ذلك ، لم يكن الغرض منه دفاعًا بل منع هجرة الصينيين الهان إلى منشوريا.