على الرغم من قمع تعدد الآلهة من قبل الدولة منذ عهد قسطنطين على الأقل في القرن الرابع ، إلا أن الثقافة اليونانية الرومانية التقليدية كانت لا تزال مؤثرة في الإمبراطورية الشرقية في القرن السادس. بدأت الفلسفة الهلنستية في الاندماج تدريجيًا في الفلسفة المسيحية الأحدث. اعتمد الفلاسفة مثل جون فيلوبونوس على الأفكار الأفلاطونية الحديثة بالإضافة إلى الفكر المسيحي والتجريبية. بسبب الوثنية النشطة لأساتذتها ، أغلق جستنيان الأكاديمية الأفلاطونية الحديثة عام 529. استمرت المدارس الأخرى في القسطنطينية وأنطاكية والإسكندرية ، والتي كانت مراكز إمبراطورية جستنيان.