كما احتفظت مكتبات الأديرة في المسيحية فى الشرق بمخطوطات مهمة. وكان من أهمها تلك الموجودة في أديرة جبل أثوس للمسيحيين الأرثوذكس، ومكتبة دير القديسة كاترين في شبه جزيرة سيناء بمصر للكنيسة القبطية.
بعد وفاة جستنيان عام 565 ، رفض خليفته ، جاستن الثاني ، دفع الجزية الكبيرة للفرس. في غضون ذلك ، غزا اللومبارديون الجرمانيون إيطاليا. بحلول نهاية القرن ، كان ثلث إيطاليا فقط في أيدي البيزنطيين.