كانت آشي مايوم تشويينج وانغمو دورجي والدة الملكة جدة آشي كيسانغ تشودن من بوتان ، صممت مايوم تشويينج وانجمو دورجي العلم بناءً على طلب ابنتها.

تنص وثيقة CBS على أن العلم الوطني الأول تم تصميمه بناءً على طلب Jigme Wangchuck ، و Druk Gyalpo الثاني من مملكة بوتان في القرن العشرين ، وتم تقديمه في عام 1949 أثناء توقيع معاهدة الهند وبوتان.

لا توضح وثيقة سي بي إس النسخ الأولى من العلم ووصفها لعلم عام 1949 لا يتوافق تمامًا مع الصور المتبقية من عام 1949. فهي تصف العلم بأنه "مربع" ، بينما تظهر نسب العلم في الصور أقرب إلى 4: 5. يصف المستند التنين بأنه "يواجه نهاية الذبابة" ، بينما يواجه التنين الظاهر في الصور الرافعة. يوصف التنين بأنه "موازٍ للذبابة" (بمعنى ، وفقًا للرسم التخطيطي في المستند ، موازيًا للطول على طول الحافة السفلية للعلم) ، بينما يبدو أن التنين في الصور لديه ميل عمودي مرتفع قليلاً. يوصف التنين بأنه "أخضر" ، لكن الظل في الصور ، إذا كان أخضر بالفعل ، يجب أن يكون شاحبًا جدًا.

تم تطوير النسخة الثانية من العلم الوطني في عام 1956 لزيارة دروك جيالبو جيغمي دورجي وانجتشوك إلى شرق بوتان. خلال الرحلة ، بدأت سكرتارية دروك جيالبو في استخدام أعلام بتصميم جديد يعتمد على صورة أول علم وطني لعام 1949 ، مع تغيير لون التنين من الأخضر إلى الأبيض. تضمنت حاشية دروك جيالبو قافلة تتكون من أكثر من مائة حصان صغير.

ابتداءً من أواخر الخمسينيات من القرن الماضي ، طلب الملك من داشو شينغخار لام ، السكرتير السابق لجيغمي دورجي وانغتشوك والمتحدث السادس للجمعية الوطنية (1971-1974) ، إجراء العديد من التعديلات على العلم. إنه مسؤول عن تصميمه الحالي ، الذي ظل دون تغيير منذ عام 1969. ورد أن الملك كان غير راضٍ عن أن أعلام بوتان المربعة المبكرة لم ترفرف مثل العلم الهندي المستطيل الذي عُرض أثناء زيارة مسؤول هندي إلى البلاد. تم بعد ذلك تغيير القياسات القياسية لعلم بوتان لتشبه علم الهند ، الذي كان يبلغ 9 أقدام في 6 أقدام.

في 8 يونيو 1972 ، وافقت الجمعية الوطنية لبوتان على القرار 28 ، الذي يدخل حيز التنفيذ قواعد العلم الوطني التي صاغها مجلس الوزراء. تحتوي القواعد على ثمانية أحكام تغطي وصف ورمزية تلوين العلم والحقول وعناصر التصميم. تتعلق القواعد الأخرى بحجم العلم بالإضافة إلى بروتوكول العلم.