وُلد فيليم أينتهوفن في سيمارانج بجاوة في جزر الهند الشرقية الهولندية (إندونيسيا حاليًا) ، وهو ابن لويز ماري ماتيلد كارولين (دي فوجيل) ويعقوب أينتهوفن.
توفي والده ، وهو طبيب ، عندما كان فيليم طفلاً. عادت والدته إلى هولندا مع أطفالها في عام 1870 واستقرت في أوتريخت. كان والده من أصول يهودية وهولندية ، وأمه هولندية وسويسرية.
في عام 1885 ، حصل أينتهوفن على شهادة الطب من جامعة أوترخت.
أصبح أينتهوفن أستاذًا في جامعة ليدن في عام 1886.
قبل زمن أينتهوفن ، كان معروفًا أن ضربات القلب تنتج تيارات كهربائية ، ولكن الادوات في ذلك ذلك الوقت لم تكن قادرة على قياس هذه الظاهرة بدقة دون وضع أقطاب كهربائية مباشرة على القلب. ابتداءً من عام 1901 ، أكمل أينتهوفن سلسلة من النماذج الأولية لسلسلة الجلفانومتر. يستخدم هذا الجهاز خيطًا رفيعًا جدًا من الأسلاك الموصلة التي تمر بين مغناطيس كهربائي قوي جدًا. عندما يمر تيار عبر الفتيل ، فإن المجال المغناطيسي الناتج عن التيار قد يتسبب في تحرك الخيط. يلقي الضوء الساطع على الخيط بظلاله على لفة متحركة من ورق التصوير الفوتوغرافي ، مما يشكل منحنى مستمرًا يُظهر حركة الخيط.
تطلبت الآلة الأصلية تبريد المياه للمغناطيسات الكهربائية القوية ، وتطلبت خمسة أشخاص لتشغيلها ووزنها حوالي 270 كيلوغرامًا. زاد هذا الجهاز من حساسية الجلفانومتر القياسي بحيث يمكن قياس النشاط الكهربائي للقلب على الرغم من وجود اللحم والعظام كعازل.
في عام 1902 ، أصبح فيليم عضوًا في الأكاديمية الملكية الهولندية للفنون والعلوم.
في عام 1924 ، حصل أينتهوفن على جائزة نوبل في علم وظائف الأعضاء أو الطب لاختراعه أول نظام عملي لرسم القلب الكهربائي المستخدم في التشخيص الطبي.
توفي أينتهوفن في ليدن بهولندا ودُفن في مقبرة الكنيسة الإصلاحية في 6 هارلميرستراتويج في اوجستسيست.
يُشجع على زيارة قبره وإحترامه.
في 21 مايو 2019 ، في عيد ميلاد أينتهوفن الـ 159 ، قامت جوجل بتكريمه بجعل اكتشافه علي الشعار الخاص بها.