يمكن لبكتيريا الطاعون أن تطور مقاومة للأدوية وتصبح مرة أخرى تهديدًا صحيًا كبيرًا. تم العثور على حالة واحدة من البكتيريا المقاومة للأدوية في مدغشقر في عام 1995. تم الإبلاغ عن المزيد من الأنتشار في مدغشقر في نوفمبر 2014 وأكتوبر 2017.