استندت وكالة المخابرات المركزية والجبهة الثورية الديمقراطية إلى جيش قوامه 1,400 جندي، الفرقة 2506، في نيكاراغوا. في ليلة 16 إلى 17 أبريل، هبطت الفرقة 2506 على طول خليج الخنازير في كوبا واشترك في معركة بالأسلحة النارية مع مليشيا ثورية محلية.
في ليلة 16/17 أبريل، قام عملاء وكالة المخابرات المركزية الأمريكية بتنظيم عملية إنزال تحريف وهمية بالقرب من باهيا هوندا، مقاطعة بينار ديل ريو. قدم أسطول صغير يحتوي على معدات تبث أصواتًا وآثارًا أخرى لهبوط الغزو المحمول على متن السفن مصدر التقارير الكوبية التي أغرت فيدل كاسترو لفترة وجيزة بعيدًا عن منطقة جبهة القتال في خليج الخنازير.
في حوالي الساعة 00:00 يوم 17 أبريل عام 1961، دخل اثنان من وكالة الإستخبارات المركزية إل سي آي بلاغار وباربارا جيه، ولكل منهما `ضابط عمليات ` في وكالة المخابرات المركزية وفريق التدمير تحت الماء المكون من خمسة رجال ضفادع بشرية، إلى خليج الخنازير (باهيا دي كوتشينوس) في الساحل الجنوبي لكوبا. قادوا قوة من أربع سفن نقل (هيوستن وريو إسكونديدو وكاريبي وأتلانتيكو) تحمل حوالي 1,400 من القوات البرية الكوبية المنفية من اللواء 2506، بالإضافة إلى دبابات اللواء M41 ووكر بولدوج، ومركبات أخرى في زورق الإنزال.
في 17 أبريل عام 1961، غزا 1400 منفيين كوبيين دربتهم الولايات المتحدة كوبا أثناء غزو خليج الخنازير. لم يلعب غيفارا دورًا رئيسيًا في القتال ، حيث قبل يوم واحد من الغزو قامت سفينة حربية تحمل مشاة البحرية بغزو الساحل الغربي لبينار ديل ريو وجذبت القوات التي يقودها جيفارا إلى تلك المنطقة.
في حوالي الساعة 01:00، وجهت بلاغار، بصفتها سفينة قيادة ساحة المعركة، عملية الإنزال الرئيسية في بلايا جيرون (التي تحمل الاسم الرمزي بلو بيتش)، بقيادة رجال الضفادع في قوارب مطاطية، تليها قوات من كاريبي في قوارب ألمنيوم صغيرة ، ثم "مركبة إنزال" و "مرفق سفن الإنزال" مع دبابات "M 41 ووكر بولدوج". باربرا جي، التي تقود هيوستن، هبطت بالمثل على بعد 35 كم شمال غرب بلايا لارجا (المسمى الرمزي الشاطئ الأحمر)، باستخدام قوارب الألياف الزجاجية الصغيرة. تأخر تفريغ القوات ليلاً بسبب أعطال في المحركات ولحقت أضرار بالقوارب بسبب الشعاب المرجانية غير المتوقعة؛ اعتقدت وكالة المخابرات المركزية في الأصل أن الشعاب المرجانية كانت من الأعشاب البحرية. عندما دخل رجال الضفادع، صُدموا عندما اكتشفوا أن الشاطئ الأحمر مضاء بالأضواء الكاشفة، مما أدى إلى تغيير موقع الهبوط على عجل. عندما هبط رجال الضفادع، اندلعت معركة بالأسلحة النارية عندما تعرضت سيارة جيب تقل ميليشيا كوبية. نجحت المليشيات القليلة في المنطقة في تحذير القوات المسلحة الكوبية عبر الراديو بعد وقت قصير من الهبوط الأول، قبل أن يتغلب الغزاة على المقاومة الرمزية.
كانت دبابات اللواء 2506 من طراز "M41 ولكر بولدوج" قد هبطت جميعها بحلول الساعة 7:30 صباحًا في بلو بيتش وجميع القوات بحلول الساعة 8:30 صباحًا. لم يستطع سان رومان في بلو بيتش ولا إرنيدو أوليفا في ريد بيتش التواصل لأن جميع أجهزة الراديو كانت غارقة في الماء أثناء عمليات الإنزال.
في حوالي الساعة 11:00 صباحًا، بدأت الحكومة الكوبية هجومًا للسيطرة على سان بلاس. أمر سان رومان جميع المظليين بالعودة من أجل السيطرة على سان بلاس، وأوقفوا الهجوم. خلال فترة ما بعد الظهر، أبقى كاسترو العميد تحت هجوم جوي ونيران المدفعية المستمرة، لكنه لم يأمر بأي هجمات كبيرة جديدة.
في الساعة 14:00، تلقى الرئيس كينيدي برقية من نيكيتا خروتشوف في موسكو، تفيد بأن الروس لن يسمحوا للولايات المتحدة بدخول كوبا، وتلمح إلى انتقام نووي سريع إلى قلب الولايات المتحدة إذا لم يتم الالتفات إلى تحذيراتهم.
خلال ليلة 17-18 أبريل، تعرضت القوة الموجودة في ريد بيتش لهجمات مضادة متكررة من الجيش والميليشيات الكوبية. مع تصاعد الخسائر واستخدام الذخيرة، تراجعت القوات العسكرية بشكل منتظم. لم تحقق عمليات الإنزال الجوي من أربع طائرات C-54 و 2 C-46 سوى نجاح محدود في هبوط المزيد من الذخيرة.