أعلنت فنزويلا دولة مستقلة

بعد هذه الوقائع، استمر بوليفار في الحكم في بيئة غير مستقرة، محاصرة بنزاعات جزئية. حدثت الانتفاضات في غرناطة الجديدة وفنزويلا والإكوادور خلال العامين التاليين. واتهمه الانفصاليون بخيانة مبادئ الجمهورية والرغبة في إقامة دكتاتورية دائمة. أعلنت كولومبيا العظمى الحرب على بيرو عندما قام الرئيس لا مار بغزو غواياكيل. هُزم لاحقًا على يد مارشال أنطونيو خوسيه دي سوكري في معركة بورتيت دي تاركوي في 27 فبراير عام 1829. و قُتل سوكري في 4 يونيو عام 1830. أراد الجنرال خوان خوسيه فلوريس فصل المقاطعات الجنوبية (كيتو، وغواياكيل، وأزواي) المعروفة باسم مقاطعة الإكوادور، من كولومبيا العظمى لتشكيل دولة مستقلة ويُصبح أول رئيس لها. أُعلنت فنزويلا دولة مستقلة في 13 يناير عام 1830، وحافظ خوسيه أنطونيو بايز على رئاسة ذلك البلد عن طريق نفي بوليفار.